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DNA methylation marker identification and poly-methylation risk score in prediction of healthspan termination

DNA甲基化 表观遗传学 生物 甲基化 生命银行 遗传学 DNA 计算生物学 基因 生物信息学 基因表达
作者
Meiqi Yang,Mei Wang,Xiaoyu Zhao,Furong Xu,Sen Liang,Yifan Wang,N Wang,Muhammed Lamin Sambou,Hongbing Shen,Juncheng Dai
出处
期刊:Epigenomics [Future Medicine]
卷期号:16 (7): 461-472
标识
DOI:10.2217/epi-2023-0343
摘要

Aim: To elucidate the epigenetic consequences of DNA methylation in healthspan termination (HST), considering the current limited understanding. Materials & methods: Genetically predicted DNA methylation models were established (n = 2478). These models were applied to genome-wide association study data on HST. Then, a poly-methylation risk score (PMRS) was established in 241,008 individuals from the UK Biobank. Results: Of the 63,046 CpGs from the prediction models, 13 novel CpGs were associated with HST. Furthermore, people with high PMRSs showed higher HST risk (hazard ratio: 1.18; 95% CI: 1.13-1.25). Conclusion: The study indicates that DNA methylation may influence HST by regulating the expression of genes (e.g., PRMT6, CTSK). PMRSs have a promising application in discriminating subpopulations to facilitate early prevention.
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