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Genome-wide identification of the GDSL-type esterase/lipase protein (GELP) gene family in Ricinus communis and its transcriptional regulation during germination and seedling establishment under different abiotic stresses

脂肪酶 蓖麻属 酯酶 发芽 非生物成分 生物 基因 基因家族 苗木 非生物胁迫 基因组 鉴定(生物学) 植物 遗传学 生物化学 生态学
作者
Cíntia Almeida,Rhaíssa R. Barbosa,Caline G. Ferraz,Renato Delmondez de Castro,Paulo R. Ribeiro
出处
期刊:Plant Physiology and Biochemistry [Elsevier]
卷期号:214: 108939-108939
标识
DOI:10.1016/j.plaphy.2024.108939
摘要

GDSL-type esterase/lipase protein (GELP) genes are crucial in the specialized lipid metabolism, in the responses to abiotic stresses, and in the regulation of plant homeostasis. R. communis is an important oilseed crop species that can sustain growth and productivity when exposed to harsh environmental conditions. Herein, we raised the question of whether the GELP gene family could be involved in the acquisition of R. communis tolerance to abiotic stresses during seed germination and seedling establishment. Thus, we used bioinformatics and transcriptomics to characterize the R. communis GELP gene family. R. communis genome possesses 96 GELP genes that were characterized by extensive bioinformatics, including phylogenetic analysis, subcellular localization, exon-intron distribution, the analysis of regulatory cis-elements, tandem duplication, and physicochemical properties. Transcriptomics indicated that numerous RcGELP genes are readily responsive to high-temperature and salt stresses and might be potential candidates for genome editing techniques to develop abiotic stress-tolerant crops.
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