Deconvolution of Human Urine across the Transcriptome and Metabolome

代谢组 转录组 反褶积 尿 计算生物学 生物 化学 代谢组学 色谱法 计算机科学 内分泌学 生物化学 基因 基因表达 算法
作者
Sevahn K. Vorperian,Brian C. DeFelice,Joseph A. Buonomo,Hagop J. Chinchinian,Ira J. Gray,Yan Jia,Kathleen E. Mach,Vinh La,Timothy J. Lee,Joseph C. Liao,Richard A. Lafayette,Gabriel B. Loeb,Carolyn R. Bertozzi,Stephen R. Quake
出处
期刊:Clinical Chemistry [American Association for Clinical Chemistry]
标识
DOI:10.1093/clinchem/hvae137
摘要

Early detection of the cell type changes underlying several genitourinary tract diseases largely remains an unmet clinical need, where existing assays, if available, lack the cellular resolution afforded by an invasive biopsy. While messenger RNA in urine could reflect the dynamic signal that facilitates early detection, current measurements primarily detect single genes and thus do not reflect the entire transcriptome and the underlying contributions of cell type-specific RNA.

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