An atlas of neural crest lineages along the posterior developing zebrafish at single-cell resolution

生物 神经嵴 间充质 斑马鱼 Hox基因 胚胎干细胞 脊椎动物 干细胞 细胞生物学 电池类型 命运图 祖细胞 细胞分化 神经干细胞 Wnt信号通路 细胞 基因 遗传学 胚胎 基因表达 信号转导
作者
Aubrey G.A. Howard,Phillip A Baker,Rodrigo Ibarra‐García‐Padilla,Joshua Moore,Lucia J Rivas,James J. Tallman,Eileen W. Singleton,Jessa L Westheimer,Julia A Corteguera,Rosa A. Uribe
出处
期刊:eLife [eLife Sciences Publications, Ltd.]
卷期号:10 被引量:37
标识
DOI:10.7554/elife.60005
摘要

Neural crest cells (NCCs) are vertebrate stem cells that give rise to various cell types throughout the developing body in early life. Here, we utilized single-cell transcriptomic analyses to delineate NCC-derivatives along the posterior developing vertebrate, zebrafish, during the late embryonic to early larval stage, a period when NCCs are actively differentiating into distinct cellular lineages. We identified several major NCC/NCC-derived cell-types including mesenchyme, neural crest, neural, neuronal, glial, and pigment, from which we resolved over three dozen cellular subtypes. We dissected gene expression signatures of pigment progenitors delineating into chromatophore lineages, mesenchyme cells, and enteric NCCs transforming into enteric neurons. Global analysis of NCC derivatives revealed they were demarcated by combinatorial hox gene codes, with distinct profiles within neuronal cells. From these analyses, we present a comprehensive cell-type atlas that can be utilized as a valuable resource for further mechanistic and evolutionary investigations of NCC differentiation.

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