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Solid-state nanopores towards single-molecule DNA sequencing

纳米孔 DNA 纳米孔测序 DNA测序 计算生物学 DNA测序器 固态 计算机科学 遗传学 纳米技术 生物 材料科学 工程类 工程物理
作者
Yusuke Goto,Rena Akahori,Itaru Yanagi,Ken-ichi Takeda
出处
期刊:Journal of Human Genetics [Springer Nature]
卷期号:65 (1): 69-77 被引量:53
标识
DOI:10.1038/s10038-019-0655-8
摘要

Nanopore DNA sequencing offers a new paradigm owing to its extensive potential for long-read, high-throughput detection of nucleotide modification and direct RNA sequencing. Given the remarkable advances in protein nanopore sequencing technology, there is still a strong enthusiasm in exploring alternative nanopore-sequencing techniques, particularly those based on a solid-state nanopore using a semiconductor material. Since solid-state nanopores provide superior material robustness and large-scale integrability with on-chip electronics, they have the potential to surpass the limitations of their biological counterparts. However, there are key technical challenges to be addressed: the creation of an ultrasmall nanopore, fabrication of an ultrathin membrane, control of the ultrafast DNA speed and detection of four nucleotides. Extensive research efforts have been devoted to resolving these issues over the past two decades. In this review, we briefly introduce recent updates regarding solid-state nanopore technologies towards DNA sequencing. It can be envisioned that emerging technologies will offer a brand new future in DNA-sequencing technology.
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