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Cloning, biochemical characterization and molecular docking of novel thermostable β-glucosidase BglA9 from Anoxybacillus ayderensis A9 and its application in de-glycosylation of Polydatin

酶动力学 化学 生物转化 糖基化 基质(水族馆) 动力学 色谱法 生物化学 核化学 立体化学 活动站点 生物 物理 发酵 量子力学 生态学
作者
Numan Saleh Zada,Ali Osman Beldüz,Halil İbrahim Güler,Miray Sahinkaya,Sanam Islam Khan,Marium Saba,Kadriye İnan,Yakup Kara,Sevgi Kolaylı,Malik Badshah,Aamer Ali Shah,Samiullah Khan
出处
期刊:International Journal of Biological Macromolecules [Elsevier]
卷期号:193: 1898-1909 被引量:16
标识
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2021.11.021
摘要

This study reports a novel BglA9 gene of 1345 bp encoding β-glucosidase from Anoxybacillus ayderensis A9, which was amplified and expressed in E. coli BL21 (DE3): pLysS cells, purified with Ni-NTA column having molecular weight of 52.6 kDa and was used in the bioconversion of polydatin to resveratrol. The kinetic parameters values using pNPG as substrate were Km (0.28 mM), Vmax (43.8 μmol/min/mg), kcat (38.43 s-1) and kcat/Km (135.5 s-1 mM-1). The BglA9 was active in a broad pH range and had an activity half-life around 24 h at 50 °C. The de-glycosylation efficiency of BglA9 for polydatin was determined by estimating the amount of glucose released after enzymatic reaction by a dinitrosalicylic acid (DNS) assay. The kinetic parameters of BglA9 for polydatin were 5.5 mM, 20.84 μmol/min/mg, 18.28 s-1and 3.27 s-1 mM-1 for Km, Vmax, kcat, and kcat/Km values, respectively. The Ki value for glucose was determined to be 1.7 M. The residues Gln19, His120, Glu355, Glu409, Glu178, Asn222 may play a crucial role in the deglycosylation as revealed by the 3D structure of enzyme docked with polydatin.
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