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Lymphangioleiomyomatosis (LAM) Cell Atlas

淋巴管平滑肌瘤病 医学 表观遗传学 细胞 病理 生物信息学 结节性硬化 计算生物学 生物 内科学 遗传学 基因表达 DNA甲基化 基因
作者
Yina Du,Minzhe Guo,Yixin Wu,Andrew J. Wagner,Anne‐Karina T. Perl,Kathryn A. Wikenheiser‐Brokamp,Jane Yu,Nishant Gupta,Elizabeth J. Kopras,Vera P. Krymskaya,Kseniya Obraztsova,Yan Tang,David J. Kwiatkowski,Elizabeth P. Henske,Francis X. McCormack,Yan Xu
出处
期刊:Thorax [BMJ]
卷期号:78 (1): 85-87 被引量:9
标识
DOI:10.1136/thoraxjnl-2022-218772
摘要

Lymphangioleiomyomatosis (LAM) is a rare lung disease of women, causing cystic remodelling of the lung and progressive respiratory failure. The cellular composition, microenvironment and cellular interactions within the LAM lesion remain unclear. To facilitate data sharing and collaborative LAM research, we performed an integrative analysis of single-cell data compiled from lung, uterus and kidney of patients with LAM from three research centres and developed an LAM Cell Atlas (LCA) Web-Portal. The LCA offers a variety of interactive options for investigators to search, visualise and reanalyse comprehensive single-cell multiomics data sets to reveal dysregulated genetic programmes at transcriptomic, epigenomic and cell–cell connectome levels.
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