Strategies for targeting RNA with small molecule drugs

可药性 计算生物学 小分子 核糖核酸 药物发现 人类蛋白质组计划 生物 蛋白质组 基因组 人类基因组 基因 生物信息学 遗传学 蛋白质组学
作者
Christopher L. Haga,Donald G. Phinney
出处
期刊:Expert Opinion on Drug Discovery [Taylor & Francis]
卷期号:18 (2): 135-147 被引量:9
标识
DOI:10.1080/17460441.2022.2111414
摘要

Introduction Historically, therapeutic treatment of disease has been restricted to targeting proteins. Of the approximately 20,000 translated human proteins, approximately 1600 are associated with diseases. Strikingly, less than 15% of disease-associated proteins are predicted or known to be 'druggable.' While the concept and narrative of protein druggability continue to evolve with the development of novel technological and pharmacological advances, most of the human proteome remains undrugged. Recent genomic studies indicate that less than 2% of the human genome encodes for proteins, and while as much as 75% of the genome is transcribed, RNA has largely been ignored as a druggable target for therapeutic interventions.Areas covered This review delineates the theory and techniques involved in the development of small molecule inhibitors of RNAs from brute force, high-throughput screening technologies to de novo molecular design using computational machine and deep learning. We will also highlight the potential pitfalls and limitations of targeting RNA with small molecules.Expert opinion Although significant advances have recently been made in developing systems to identify small molecule inhibitors of RNAs, many challenges remain. Focusing on RNA structure and ligand binding sites may help bring drugging RNA in line with traditional protein drug targeting.
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