Allosteric strand displacement isothermal amplification for the visual detection of Toxoplasma gondii in 30 minutes

弓形虫 环介导等温扩增 底漆(化妆品) 基因组DNA 检出限 溴百里酚蓝 化学 DNA提取 萃取(化学) 滤波器(信号处理) 计算生物学 计算机科学 聚合酶链反应 生物 色谱法 计算机视觉 遗传学 基因 抗体 DNA 有机化学
作者
Lei Wang,Zhaoxuan Zhang,Y. C. Liu,Shenghao Lin,Wenqiang Zhang,Longjiao Zhu,Wentao Xu,Yulan Dong
出处
期刊:Biosensors and Bioelectronics [Elsevier BV]
卷期号:251: 116132-116132 被引量:1
标识
DOI:10.1016/j.bios.2024.116132
摘要

Early detection of Toxoplasma gondii (T. gondii) is critical due to a lack of effective treatment for toxoplasmosis.This study established a simple, cost-effective, and rapid colorimetric detection method for T. gondii. The entire testing process, from sample collection to results, takes only 0.5 h. These characteristics fulfill the demands of researchers seeking rapid target detection with minimal equipment reliance. For genomic extraction, this study evaluated the ability of two filter papers to capture genomes. A rapid genomic extraction device combined with the two filter papers was designed to simplify the genomic extraction process, which was completed within 10 min and increased the detection sensitivity tenfold. The method utilized a simplified primer design for isothermal amplification, namely allosteric strand displacement (ASD), and employed an underutilized commercial color indicator, Bromothymol Blue (BTB), for signal output. Compared with other reported indicators, BTB exhibited a more pronounced color change, shifting from blue to yellow in positive samples, facilitating easier visual differentiation. The reaction was completed in 20 min with a limit of detection (LOD) as low as 0.014 T. gondii per microliter.
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