Ligandability Assessment of IL-1β by Integrated Hit Identification Approaches

化学 鉴定(生物学) 虚拟筛选 药物发现 计算生物学 免疫系统 细胞因子 白细胞介素 残留物(化学) 组合化学 生物化学 免疫学 生物 植物
作者
Anna Vulpetti,Jean‐Michel Rondeau,Marie-Hélène Bellance,Jutta Blank,Ralf Boesch,Andreas Boettcher,Frédéric Bornancin,Sylvia Buhr,Lauren E. Connor,Christoph E. Dumelin,Oliver Esser,Michael Hediger,Samuel Hintermann,Ulrich Hommel,Elke Koch,Guillaume Lapointe,Lukas Leder,Sylvie Lehmann,Philipp Lehr,Peter Meier,Lionel Muller,Daniela Ostermeier,Paul Ramage,Sihame Schiebel-Haddad,Alexander Baxter Smith,Aleksandar Stojanović,Juraj Velcicky,Rina Yamamoto,Konstanze Hurth
出处
期刊:Journal of Medicinal Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:67 (10): 8141-8160
标识
DOI:10.1021/acs.jmedchem.4c00240
摘要

Human interleukin-1β (IL-1β) is a pro-inflammatory cytokine that plays a critical role in the regulation of the immune response and the development of various inflammatory diseases. In this publication, we disclose our efforts toward the discovery of IL-1β binders that interfere with IL-1β signaling. To this end, several technologies were used in parallel, including fragment-based screening (FBS), DNA-encoded library (DEL) technology, peptide discovery platform (PDP), and virtual screening. The utilization of distinct technologies resulted in the identification of new chemical entities exploiting three different sites on IL-1β, all of them also inhibiting the interaction with the IL-1R1 receptor. Moreover, we identified lysine 103 of IL-1β as a target residue suitable for the development of covalent, low-molecular-weight IL-1β antagonists.
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