Transcriptome sequencing and Mendelian randomization analysis identified biomarkers related to neutrophil extracellular traps in diabetic retinopathy

生物 转录组 候选基因 基因 中性粒细胞胞外陷阱 基因表达谱 遗传学 基因表达 免疫学 炎症
作者
Linlin Hao,Songhong Wang,Lian Zhang,Jie Huang,Yanlong Zhang,Xuejiao Qin
出处
期刊:Frontiers in Immunology [Frontiers Media]
卷期号:15
标识
DOI:10.3389/fimmu.2024.1408974
摘要

In the development of diabetic retinopathy (DR), neutrophil infiltration hastens the adhesion between neutrophils and endothelial cells, leading to inflammation. Meanwhile, neutrophil extracellular traps (NETs) produced by neutrophils could clear aging blood vessels, setting the stage for retinal vascular regeneration. To explore the mechanism of NETs-related genes in DR, the transcriptome of NETs from normal and DR individuals were analyzed with gene sequencing and mendelian randomization (MR) analysis. Five NETs-related genes were identified as key genes. Among these genes, CLIC3, GBP2, and P2RY12 were found to be risk factors for Proliferative DR(PDR), whereas HOXA1 and PSAP were protective factors. Further verification by qRT-PCR recognized GBP2, P2RY12 and PSAP as NETs-associated biomarkers in PDR.
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