Utility of next‐generation sequencing technologies for the efficient genetic resolution of haematological disorders

桑格测序 外显子组测序 DNA测序 生物 大规模并行测序 先天性中性粒细胞减少 幼年粒单核细胞白血病 遗传学 表型 克拉斯 全基因组测序 突变 计算生物学 Diamond–Blackfan贫血 基因 生物信息学 基因组 干细胞 核糖体 核糖核酸 造血
作者
Jianguo Zhang,Pasquale Barbaro,Y H Guo,Ahmad Alodaib,Jianlong Li,Wendy Gold,Lesley C. Adès,Brendan J. Keating,Xun Xu,James Teo,Hákon Hákonarson,John Christodoulou
出处
期刊:Clinical Genetics [Wiley]
卷期号:89 (2): 163-172 被引量:18
标识
DOI:10.1111/cge.12573
摘要

Next‐generation sequencing ( NGS ) has now evolved to be a relatively affordable and efficient means of detecting genetic mutations. Whole genome sequencing ( WGS ) or whole exome sequencing ( WES ) offers the opportunity for rapid diagnosis in many paediatric haematological conditions, where phenotypes are variable and either a large number of genes are involved, or the genes are large making sanger sequencing expensive and labour‐intensive. NGS offers the potential for gene discovery in patients who do not have mutations in currently known genes. This report shows how WES was used in the diagnosis of six paediatric haematology cases. In four cases (Diamond–Blackfan anaemia, congenital neutropenia ( n = 2), and Fanconi anaemia), the diagnosis was suspected based on classical phenotype, and NGS confirmed those suspicions. Mutations in RPS19 , ELANE and FANCD2 were found. The final two cases ( MYH9 associated macrothrombocytopenia associated with multiple congenital anomalies; atypical juvenile myelomonocytic leukaemia associated with a KRAS mutation) highlight the utility of NGS where the diagnosis is less certain, or where there is an unusual phenotype. We discuss the advantages and limitations of NGS in the setting of these cases, and in haematological conditions more broadly, and discuss where NGS is most efficiently used.
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