Transcriptome analysis provides insights into the effects of myo-inositol on the turbot Scophthalmus maximus

多宝鱼 菱鲆属 生物 转录组 肌醇 渔业 动物 计算生物学 遗传学 基因 基因表达 受体
作者
Wenxiao Cui,Aijun Ma
出处
期刊:Fish & Shellfish Immunology [Elsevier]
卷期号:106: 691-704 被引量:10
标识
DOI:10.1016/j.fsi.2020.07.019
摘要

Abstract Myo-inositol is an essential vitamin for most animals, and it can modulate multiple physiological functions. In this study, we performed transcriptome gene expression profiling of gill tissue from turbot Scophthalmus maximus fed different concentrations of myo-inositol (0, 300, 600, 900, 1200 mg/kg). Results of expression tendency analysis, Weighted Gene Co-Expression Network Analysis (WGCNA), integrated transcriptome analyses, and KEGG annotation analysis of all differentially expressed genes (DEGs) demonstrated that the cytokine-cytokine receptor interaction played a core role in effects of myo-inositol on turbot, which was followed by the Jak-STAT signaling pathway. The results of qRT-PCR also showed myo-inositol mediated the gene expression of the cytokine-cytokine receptor interaction and the Jak-STAT signaling pathway in turbot. The ELISA assay indicated that myo-inositol affected the concentration change of interleukins (IL-2 and IL-10). Consequently, the interleukins associated with immune functions in the cytokine-cytokine receptor interaction played a core role in the effects of myo-inositol on turbot, which was followed by the Jak-STAT signaling pathway. Additionally, 10 hub genes associated with myo-inositol-traits were identified via WGCNA.
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