Simple Amplification‐Based Assay: A Nucleic Acid–Based Point‐of‐Care Platform for HIV‐1 Testing

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作者
Helen Lee,Magda Anastassova Dineva,Yii Leng Chua,Allyson V. Ritchie,Ines Ushiro‐Lumb,Craig A. Wisniewski
出处
期刊:The Journal of Infectious Diseases [Oxford University Press]
卷期号:201 (s1): S65-S72 被引量:97
标识
DOI:10.1086/650385
摘要

A new nucleic acid-based assay (simple amplification-based assay [SAMBA]) for rapid visual detection of human immunodeficiency virus-type 1 (HIV-1) by dipstick is described. The assay was designed to be simple, stable, robust, self-contained, and capable of detecting a broad spectrum of HIV-1 subtypes and recombinant forms.The performance of the SAMBA HIV-1 test (amplification and detection chemistry) was evaluated using the World Health Organization HIV-1 RNA Genotype Reference Panel, with clinical samples representing various viral subtypes and recombinant forms common in sub-Saharan Africa. Sixty-nine randomly selected and blinded clinical samples that had undergone HIV-1 genotypic resistance analyses in a large London teaching hospital were also tested. These samples included 14 different viral subtypes or recombinant forms with viral loads of 78-9.5 x 10(6) copies/mL.The sensitivity and viral subtype coverage of the SAMBA HIV-1 test were either comparable to or better than those of the commercially available nucleic acid-based HIV-1 diagnostic tests.The unique characteristics and competitive performance of the SAMBA HIV-1 test render it suitable for point-of-care and near-patient testing in both developed and developing countries.

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