Changing expression profiles of mRNA, lncRNA, circRNA, and miRNA in lung tissue reveal the pathophysiological of bronchopulmonary dysplasia (BPD) in mouse model

支气管肺发育不良 小RNA 小桶 生物 长非编码RNA 竞争性内源性RNA 信使核糖核酸 计算生物学 核糖核酸 基因 生物信息学 基因表达 遗传学 基因本体论 胎龄 怀孕
作者
Juan Wang,Jing Yin,Xinyun Wang,Heng Liu,Yin Hu,Xiangyun Yan,Bin Zhang,Zhangbin Yu,Song Han
出处
期刊:Journal of Cellular Biochemistry [Wiley]
卷期号:120 (6): 9369-9380 被引量:35
标识
DOI:10.1002/jcb.28212
摘要

Abstract New perinatal care technologies have improved the survival rate of preterm neonates, but the prevalence of bronchopulmonary dysplasia (BPD), one of the most intractable problems in neonatal intensive care unit (NICU), remains unchanged. In present study, high‐throughput sequencing (HTS) was performed to detect the expression profiles of long noncoding RNAs (lncRNAs), messenger RNAs (mRNAs), circular RNAs (circRNAs), and microRNAs (miRNAs) in hyperoxia‐induced BPD mouse model. Significant differentially expressed RNAs were selected and clustered between the BPD group and the control group. The results revealed that expressions of 1778 lncRNAs, 1240 mRNAs, 97 circRNAs, and 201 miRNAs were significantly altered in the BPD group. Gene ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) were performed to predict the potential functions of differentially expressed RNAs. lncRNA‐mRNA and circRNA‐miRNA coexpression networks were constructed to detect their association with the pathogenesis of BPD. Our study provides a systematic perspective on the potential function of RNAs during BPD.
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