清晨好,您是今天最早来到科研通的研友!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您科研之路漫漫前行!

Host–guest binding selectivity of ethylated pillar[5]arene (EtP5A) towards octane, 1,7-octadiene, and 1,7-octadiyne: a computational investigation

化学 支柱 辛烷值 选择性 计算化学 立体化学
作者
Adel Krid,Lotfi Belkhiri,Hamza Allal,Aleksey E. Kuznetsov,Abdou Boucekkine
出处
期刊:Structural Chemistry [Springer Nature]
卷期号:34 (2): 625-638
标识
DOI:10.1007/s11224-022-02002-1
摘要

Host–guest binding selectivity of the perethylated pillar[5]arene (EtP5A) macrocycles with aliphatic modified hydrocarbons, i.e., octane, 1,7-octadiene, and 1,7-octadiyne as guests, has been investigated computationally employing molecular docking simulations. Density functional theory (DFT) investigations were also performed on these host–guest complexes using the dispersion-corrected approach BLYP-D3(BJ)/TZP/COSMO calculations as implemented in the ADF program and two dispersion-corrected density functionals, ωB97XD and B97D, along with the 6-311G* basis set, coupled with the PCM solvation model as implemented in the Gaussian software. We performed analysis of the frontier molecular orbitals (FMO) and natural bond orbitals (NBO), energy decomposition analysis (EDA), and noncovalent interaction (NCI-RDG) analysis. The study sheds light on the structures and binding energetics of EtP5A with the above-mentioned guests as well as on the physicochemical nature of the noncovalent interactions involved in these host–guest inclusion complexes. Based on the docking simulations, the EtP5A host revealed slightly better binding ability in the complex with the alkyne guest than with the octane and alkene, as corroborated by the EDA analysis. The results showed that the complexation of EtP5A with the hydrocarbons is mainly governed by the interplay of electrostatic interactions and dispersive noncovalent interactions. These results agree well with NCI-RDG and NBO analysis showing that host–guest binding interactions result predominantly from electrostatic C-H···π and van der Waals interactions, the H-bonding being weak or not observed. The results obtained using different computational methods were found to be in good agreement and complementary.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
海英完成签到,获得积分10
19秒前
不能吃太饱完成签到 ,获得积分10
27秒前
Drlee完成签到 ,获得积分10
36秒前
博博要毕业完成签到 ,获得积分10
39秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
1分钟前
丘比特应助Luke采纳,获得10
1分钟前
彩色的芷容完成签到 ,获得积分10
1分钟前
xiaobai123456完成签到,获得积分10
1分钟前
简单的冬瓜完成签到,获得积分10
1分钟前
酷波er应助Dongjie采纳,获得10
1分钟前
1分钟前
Luke发布了新的文献求助10
1分钟前
1分钟前
邱佩群完成签到 ,获得积分10
2分钟前
小蘑菇应助Luke采纳,获得10
2分钟前
练得身形似鹤形完成签到 ,获得积分10
2分钟前
2分钟前
卜哥完成签到,获得积分10
2分钟前
guoguo1119完成签到 ,获得积分10
2分钟前
moxiang发布了新的文献求助10
2分钟前
乐正怡完成签到 ,获得积分0
2分钟前
Chelsea完成签到,获得积分10
2分钟前
2分钟前
英姑应助moxiang采纳,获得10
2分钟前
2分钟前
Mia233完成签到 ,获得积分10
2分钟前
Dongjie发布了新的文献求助10
2分钟前
Luke发布了新的文献求助10
2分钟前
喵了个咪完成签到 ,获得积分10
2分钟前
小二郎应助Luke采纳,获得10
2分钟前
chcmy完成签到 ,获得积分0
2分钟前
3分钟前
Luke发布了新的文献求助10
3分钟前
小糊涂完成签到 ,获得积分10
3分钟前
dx完成签到,获得积分10
3分钟前
debu9完成签到,获得积分10
3分钟前
酷波er应助科研通管家采纳,获得10
3分钟前
锅架了完成签到 ,获得积分10
3分钟前
雪酪芋泥球完成签到 ,获得积分10
3分钟前
甜乎贝贝完成签到 ,获得积分0
3分钟前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Encyclopedia of Reproduction Third Edition 3000
Comprehensive Methanol Science Production, Applications, and Emerging Technologies 2000
From Victimization to Aggression 1000
化妆品原料学 1000
小学科学课程与教学 500
Study and Interlaboratory Validation of Simultaneous LC-MS/MS Method for Food Allergens Using Model Processed Foods 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 生物 医学 工程类 计算机科学 有机化学 物理 生物化学 纳米技术 复合材料 内科学 化学工程 人工智能 催化作用 遗传学 数学 基因 量子力学 物理化学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 5645003
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 4767024
关于积分的说明 15026102
捐赠科研通 4803370
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2568275
邀请新用户注册赠送积分活动 1525669
关于科研通互助平台的介绍 1485222