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Autophagic compound database: A resource connecting autophagy‐modulating compounds, their potential targets and relevant diseases

自噬 细胞生物学 生物 细胞器 计算生物学 生物化学 细胞凋亡
作者
Yiqi Deng,Lingjuan Zhu,Haoyang Cai,Guan Wang,Bo Liu
出处
期刊:Cell Proliferation [Wiley]
卷期号:51 (3) 被引量:36
标识
DOI:10.1111/cpr.12403
摘要

Abstract Objectives Autophagy, a highly conserved lysosomal degradation process in eukaryotic cells, can digest long‐lived proteins and damaged organelles through vesicular trafficking pathways. Nowadays, mechanisms of autophagy have been gradually elucidated and thus the discovery of small‐molecule drugs targeting autophagy has always been drawing much attention. So far, some autophagy‐related web servers have been available online to facilitate scientists to obtain the information relevant to autophagy conveniently, such as HAD b, CTLPS canner, iLIR server and nc RD eath DB . However, to the best of our knowledge, there is not any web server available about the autophagy‐modulating compounds. Methods According to published articles, all the compounds and their relations with autophagy were anatomized. Subsequently, an online Autophagic Compound Database ( ACDB ) ( http://www.acdbliulab.com/ ) was constructed, which contained information of 357 compounds with 164 corresponding signalling pathways and potential targets in different diseases. Results We achieved a great deal of information of autophagy‐modulating compounds, including compounds, targets/pathways and diseases. ACDB is a valuable resource for users to access to more than 300 curated small‐molecule compounds correlated with autophagy. Conclusions Autophagic compound database will facilitate to the discovery of more novel therapeutic drugs in the near future.

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