A bound reaction intermediate sheds light on the mechanism of nitrogenase

固氮酶 化学 辅因子 硫黄 质子化 氮气 立体化学 固氮 光化学 活动站点 结晶学 离子 生物化学 有机化学
作者
Daniel Sippel,Michael Rohde,H. Netzer,Christian Trncik,Jakob Gies,Katharina Grunau,Ivana Djurdjević,Laure Decamps,Susana L. A. Andrade,Oliver Einsle
出处
期刊:Science [American Association for the Advancement of Science (AAAS)]
卷期号:359 (6383): 1484-1489 被引量:262
标识
DOI:10.1126/science.aar2765
摘要

Sulfur steps aside for nitrogen Enzymatic conversion of molecular nitrogen to ammonia requires a dance of electrons and protons. The stage for that dance is the nitrogenase cofactor, a carefully constructed cluster of iron, sulfur, and carbon with homocitrate and, in some cases, bicarbonate appendages, as well as a secondary metal ion that defines the class of enzyme. The question of how this cofactor binds nitrogen has been vexingly difficult to answer. Sippel et al. report a high-resolution structure of the vanadium nitrogenase with a light atom, interpreted as nitrogen, bound to the FeV cofactor. A sulfur atom is displaced from the cofactor in this structure and is observed resting in a holding site formed by rearrangement of a glutamine residue. The putative bridging nitrogen atom suggests that diatomic nitrogen may bind to the cluster in a head-on manner, with the glutamine side chain stabilizing protonated intermediates as they are reduced. Science , this issue p. 1484
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