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C2FTFNet: Coarse-to-fine transformer network for joint optic disc and cup segmentation

分割 计算机科学 人工智能 霍夫变换 变压器 深度学习 视盘 计算机辅助设计 模式识别(心理学) 青光眼 计算机视觉 工程类 电压 图像(数学) 工程制图 眼科 电气工程 医学
作者
Yugen Yi,Yan Jiang,Bin Zhou,Ningyi Zhang,Jiangyan Dai,Xin Huang,Qinqin Zeng,Wei Zhou
出处
期刊:Computers in Biology and Medicine [Elsevier]
卷期号:164: 107215-107215 被引量:10
标识
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107215
摘要

Glaucoma is a leading cause of worldwide blindness and visual impairment, making early screening and diagnosis is crucial to prevent vision loss. Cup-to-Disk Ratio (CDR) evaluation serves as a widely applied approach for effective glaucoma screening. At present, deep learning methods have exhibited outstanding performance in optic disk (OD) and optic cup (OC) segmentation and maturely deployed in CAD system. However, owning to the complexity of clinical data, these techniques could be constrained. Therefore, an original Coarse-to-Fine Transformer Network (C2FTFNet) is designed to segment OD and OC jointly , which is composed of two stages. In the coarse stage, to eliminate the effects of irrelevant organization on the segmented OC and OD regions, we employ U-Net and Circular Hough Transform (CHT) to segment the Region of Interest (ROI) of OD. Meanwhile, a TransUnet3+ model is designed in the fine segmentation stage to extract the OC and OD regions more accurately from ROI. In this model, to alleviate the limitation of the receptive field caused by traditional convolutional methods, a Transformer module is introduced into the backbone to capture long-distance dependent features for retaining more global information. Then, a Multi-Scale Dense Skip Connection (MSDC) module is proposed to fuse the low-level and high-level features from different layers for reducing the semantic gap among different level features. Comprehensive experiments conducted on DRIONS-DB, Drishti-GS, and REFUGE datasets validate the superior effectiveness of the proposed C2FTFNet compared to existing state-of-the-art approaches.
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