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Genome-Wide Identification of the IQM Gene Family and Their Transcriptional Responses to Abiotic Stresses in Kiwifruit (Actinidia eriantha)

生物 基因 基因家族 遗传学 猕猴桃 非生物胁迫 系统发育树 基因复制 非生物成分 基因组 猕猴桃 基因表达 植物 古生物学
作者
Minyan Xu,Zhi Zhang,Chengcheng Ling,Yuhuan Jiao,Xin Zhang
出处
期刊:Genes [Multidisciplinary Digital Publishing Institute]
卷期号:15 (2): 147-147
标识
DOI:10.3390/genes15020147
摘要

IQM is a plant-specific calcium-binding protein that plays a pivotal role in various aspects of plant growth response to stressors. We investigated the IQM gene family and its expression patterns under diverse abiotic stresses and conducted a comprehensive analysis and characterization of the AeIQMs, including protein structure, genomic location, phylogenetic relationships, gene expression profiles, salt tolerance, and expression patterns of this gene family under different abiotic stresses. Based on phylogenetic analysis, these 10 AeIQMs were classified into three distinct subfamilies (I–III). Analysis of the protein motifs revealed a considerable level of conservation among these AeIQM proteins within their respective subfamilies in kiwifruit. The genomic distribution of the 10 AeIQM genes spanned across eight chromosomes, where four pairs of IQM gene duplicates were associated with segmental duplication events. qRT-PCR analysis revealed diverse expression patterns of these AeIQM genes under different hormone treatments, and most AeIQMs showed inducibility by salt stress. Further investigations indicated that overexpression of AeIQMs in yeast significantly enhanced salt tolerance. These findings suggest that AeIQM genes might be involved in hormonal signal transduction and response to abiotic stress in Actinidia eriantha. In summary, this study provides valuable insights into the physiological functions of IQMs in kiwifruit.
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