Prognostic Significance of Iron Metabolism and Immune-Related Genes as Risk Markers in Hepatocellular Carcinoma

肝细胞癌 小桶 免疫系统 基因 比例危险模型 癌症研究 免疫疗法 生物 医学 肿瘤科 内科学 转录组 免疫学 基因表达 遗传学
作者
Shijing Tang,Hao Chen
出处
期刊:Journal of Environmental Pathology Toxicology and Oncology [Begell House]
卷期号:43 (3): 51-67
标识
DOI:10.1615/jenvironpatholtoxicoloncol.2024050167
摘要

Hepatocellular carcinoma (HCC) is a highly lethal liver cancer with significant heterogeneity, which poses challenges in predicting prognosis and treatment outcomes. The impact of iron metabolism and immune-related genes (IMRGs) on HCC patient prognoses remains elusive. We utilized The Cancer Genome Atlas (TCGA) dataset to obtain mRNA expression data and clinical information from HCC patients. Through the application of LASSO regression and univariate/multivariate Cox regression analyses, we identified five IMRGs significantly associated with survival of HCC patients. We constructed a prognostic model comprising these five genes. The model demonstrated excellent predictive performance, not only within TCGA dataset but also when validated using the Gene Expression Omnibus (GEO) dataset. Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) enrichment analyses presented significant variations in functional categories, such as apical plasma membrane and collagen-containing extracellular matrix. Several pathways, including the PI3K-AKT signaling pathway and the calcium signaling pathway, exhibited significant variations among HCC patients with varying prognoses (<i>P</i> &#60; 0.05). Immune infiltration analysis indicated significantly lower levels of various immune cells, immune functions, and immune checkpoints, such as B cells, CD8&#43; T cells, and TILs, in the high-risk group (<i>P</i> &#60; 0.05). Immunophenoscore results suggested that the low-risk group may exhibit a more favorable response to immune therapy. Furthermore, the CellMiner database predicted anti-tumor drugs significantly associated with prognostic genes (<i>P</i> &#60; 0.001). In conclusion, our findings highlight the predictive role of IMRGs in prognosis and immune treatment of HCC, indicating that ADAMTS13, CRHBP, VIPR1, FCN3, and CLEC1B may serve as potential prognostic biomarkers for HCC.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
bill完成签到,获得积分10
1秒前
明理问柳发布了新的文献求助10
5秒前
ky应助xiaoX12138采纳,获得10
6秒前
明理问柳完成签到,获得积分10
12秒前
坚强的嚣完成签到 ,获得积分10
12秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
14秒前
gxzsdf完成签到 ,获得积分10
17秒前
我思故我在完成签到,获得积分10
19秒前
20秒前
阿帕奇完成签到 ,获得积分10
23秒前
Conner完成签到 ,获得积分10
24秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
27秒前
zhang完成签到 ,获得积分10
28秒前
wol007完成签到 ,获得积分10
30秒前
123完成签到 ,获得积分10
31秒前
Justtry完成签到 ,获得积分20
31秒前
naiyouqiu1989完成签到,获得积分10
33秒前
沿途有你完成签到 ,获得积分10
33秒前
花生四烯酸完成签到 ,获得积分10
35秒前
科科通通完成签到,获得积分10
35秒前
WYK完成签到 ,获得积分10
38秒前
38秒前
学海行舟完成签到 ,获得积分10
42秒前
黑眼圈完成签到 ,获得积分10
45秒前
幸福的羿完成签到 ,获得积分10
46秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
47秒前
霍明轩完成签到 ,获得积分10
56秒前
游艺完成签到 ,获得积分10
59秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
1分钟前
是盐的学术号吖完成签到 ,获得积分10
1分钟前
空2完成签到 ,获得积分0
1分钟前
烂漫的从彤完成签到,获得积分10
1分钟前
Wang完成签到 ,获得积分20
1分钟前
小心翼翼完成签到 ,获得积分10
1分钟前
Manzia完成签到,获得积分10
1分钟前
小丸子和zz完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
在水一方应助灵巧的傲柏采纳,获得10
1分钟前
Dr.Tang完成签到 ,获得积分10
1分钟前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
网络安全 SEMI 标准 ( SEMI E187, SEMI E188 and SEMI E191.) 1000
Inherited Metabolic Disease in Adults: A Clinical Guide 500
计划经济时代的工厂管理与工人状况(1949-1966)——以郑州市国营工厂为例 500
INQUIRY-BASED PEDAGOGY TO SUPPORT STEM LEARNING AND 21ST CENTURY SKILLS: PREPARING NEW TEACHERS TO IMPLEMENT PROJECT AND PROBLEM-BASED LEARNING 500
The Pedagogical Leadership in the Early Years (PLEY) Quality Rating Scale 410
Why America Can't Retrench (And How it Might) 400
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 纳米技术 计算机科学 内科学 化学工程 复合材料 物理化学 基因 催化作用 遗传学 冶金 电极 光电子学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 4613016
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 4018011
关于积分的说明 12436990
捐赠科研通 3700338
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2040716
邀请新用户注册赠送积分活动 1073470
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 957104