Integrating hormones and transcriptome to explore the formation of dwarf and lateral buds in Capsicum

生物 生长素 转录组 茉莉酸 矮化 赤霉素 代谢物 植物激素 基因 转录因子 数量性状位点 RNA序列 植物 遗传学 基因表达 生物化学
作者
Chengsheng Gong,Guangjun Guo,Pan BaoGui,Gao Chang-zhou,Xuan Zhu,Shubin Wang,Jinbing Liu,Wenrui Diao
出处
期刊:Scientia Horticulturae [Elsevier]
卷期号:325: 112666-112666
标识
DOI:10.1016/j.scienta.2023.112666
摘要

Plant type in pepper is an important morphological characteristic and reproductive basis, among which dwarfing and lateral buds are important traits of plant type. Significantly, the integrated analysis of metabonomics and transcriptome data helps to elucidate the key metabolites and genes in the formation of plant-type traits, which is helpful to understand the formation of target traits. However, relevant studies on pepper are still lacking. In the current study, three pepper cultivars with significant differences in the two traits were used, then, RNA-seq of stem tissues was performed based on a sequencing platform, and HPLC-LC-MS was used for metabolite determination. The results showed that the low content of key cytokines, gibberellin and high content of auxin may be the important factors causing plant dwarfing. Meanwhile, jasmonic acid may be an important metabolic factor affecting the trait of branches. Moreover, combined with metabolic pathway analysis and transcription factor analysis, a total of 131 candidate genes were obtained, which were involved in metabolite synthesis and affect the formation of two important plant-type traits. These findings provide data support for metabolic and molecular basis of trait formation and give guiding significance for the improvement of rational plant type.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
Follow给Follow的求助进行了留言
刚刚
刚刚
kkm完成签到,获得积分10
1秒前
4秒前
踏雪飞鸿发布了新的文献求助10
4秒前
ohh发布了新的文献求助10
5秒前
LX完成签到 ,获得积分10
7秒前
ww完成签到,获得积分10
7秒前
8秒前
9秒前
oceanao应助博文采纳,获得10
9秒前
迷人的冰蓝完成签到,获得积分10
10秒前
10秒前
深情安青应助迅速枕头采纳,获得10
11秒前
Simlove发布了新的文献求助10
14秒前
Sherry完成签到,获得积分10
15秒前
吹吹晚风完成签到,获得积分10
16秒前
18秒前
科研通AI2S应助777777777采纳,获得10
18秒前
19秒前
牛逼man完成签到,获得积分10
19秒前
科目三应助科研通管家采纳,获得10
20秒前
小蘑菇应助科研通管家采纳,获得10
20秒前
Jasper应助科研通管家采纳,获得10
20秒前
桐桐应助科研通管家采纳,获得10
20秒前
李爱国应助科研通管家采纳,获得10
20秒前
研友_VZG7GZ应助科研通管家采纳,获得10
20秒前
搜集达人应助科研通管家采纳,获得10
20秒前
NexusExplorer应助科研通管家采纳,获得10
20秒前
20秒前
666完成签到,获得积分10
21秒前
22秒前
666发布了新的文献求助30
22秒前
23秒前
nini发布了新的文献求助10
24秒前
若狂完成签到,获得积分10
25秒前
饱了饱了发布了新的文献求助10
26秒前
哈哈哈66发布了新的文献求助20
27秒前
一行白鹭上青天完成签到,获得积分10
28秒前
司空以蕊发布了新的文献求助10
28秒前
高分求助中
Spray / Wall-interaction Modelling by Dimensionless Data Analysis 2000
ALA生合成不全マウスでの糖代謝異常の分子機構解析 520
安全防范技术与工程 500
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
A real-time energy management strategy based on fuzzy control and ECMS for PHEVs 400
2024 Medicinal Chemistry Reviews 400
Актуализированная стратиграфическая схема триасовых отложений Прикаспийского региона. Объяснительная записка 360
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3191675
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2841005
关于积分的说明 8030939
捐赠科研通 2504476
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1337672
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 638193
邀请新用户注册赠送积分活动 606684