Integrating hormones and transcriptome to explore the formation of dwarf and lateral buds in Capsicum

生物 生长素 转录组 茉莉酸 矮化 赤霉素 代谢物 植物激素 基因 转录因子 数量性状位点 RNA序列 植物 遗传学 基因表达 生物化学
作者
Chengsheng Gong,Guangjun Guo,Pan BaoGui,Gao Chang-zhou,Xuan Zhu,Shubin Wang,Jinbing Liu,Wenrui Diao
出处
期刊:Scientia Horticulturae [Elsevier]
卷期号:325: 112666-112666
标识
DOI:10.1016/j.scienta.2023.112666
摘要

Plant type in pepper is an important morphological characteristic and reproductive basis, among which dwarfing and lateral buds are important traits of plant type. Significantly, the integrated analysis of metabonomics and transcriptome data helps to elucidate the key metabolites and genes in the formation of plant-type traits, which is helpful to understand the formation of target traits. However, relevant studies on pepper are still lacking. In the current study, three pepper cultivars with significant differences in the two traits were used, then, RNA-seq of stem tissues was performed based on a sequencing platform, and HPLC-LC-MS was used for metabolite determination. The results showed that the low content of key cytokines, gibberellin and high content of auxin may be the important factors causing plant dwarfing. Meanwhile, jasmonic acid may be an important metabolic factor affecting the trait of branches. Moreover, combined with metabolic pathway analysis and transcription factor analysis, a total of 131 candidate genes were obtained, which were involved in metabolite synthesis and affect the formation of two important plant-type traits. These findings provide data support for metabolic and molecular basis of trait formation and give guiding significance for the improvement of rational plant type.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
复杂的一一完成签到,获得积分10
刚刚
刚刚
Bing Yan发布了新的文献求助10
1秒前
喜悦松完成签到,获得积分10
1秒前
1秒前
领导范儿应助JHJ123采纳,获得30
1秒前
阿轩完成签到,获得积分10
1秒前
2秒前
淡淡代玉完成签到,获得积分20
2秒前
3秒前
嗯哼举报我不是大牛求助涉嫌违规
3秒前
科研通AI2S应助無羁采纳,获得10
3秒前
4秒前
科研通AI2S应助阿轩采纳,获得10
5秒前
飞飞发布了新的文献求助10
5秒前
曾经的凤发布了新的文献求助30
6秒前
星宫金魁完成签到 ,获得积分10
7秒前
田様应助自然的茉莉采纳,获得10
7秒前
8秒前
李爱国应助科研通管家采纳,获得10
9秒前
毛豆爸爸应助科研通管家采纳,获得10
9秒前
美好乐松应助科研通管家采纳,获得10
9秒前
大模型应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
香蕉觅云应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
美好乐松应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
10秒前
Akim应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
英俊的铭应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
李爱国应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
毛豆爸爸应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
上官若男应助科研通管家采纳,获得30
10秒前
充电宝应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
wanci应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
10秒前
11秒前
11秒前
cc完成签到,获得积分10
13秒前
14秒前
李子发布了新的文献求助10
16秒前
高分求助中
Evolution 3rd edition 1500
保险藏宝图 1000
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3183207
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2833396
关于积分的说明 7993630
捐赠科研通 2495497
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1331539
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 636332
邀请新用户注册赠送积分活动 603496