亲爱的研友该休息了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!身体可是革命的本钱,早点休息,好梦!

Nucleation and Growth of Amyloid Fibrils

纤维 成核 淀粉样纤维 化学 化学物理 结晶学 分子动力学 生物物理学 垂直的 对接(动物) 淀粉样β 计算化学 生物化学 医学 几何学 疾病 有机化学 数学 病理 护理部 生物
作者
Sharareh Jalali,Ruoyao Zhang,Mikko Haataja,Cristiano L. Dias
出处
期刊:Journal of Physical Chemistry B [American Chemical Society]
卷期号:127 (45): 9759-9770 被引量:7
标识
DOI:10.1021/acs.jpcb.3c05300
摘要

The formation of amyloid fibrils is a complex phenomenon that remains poorly understood at the atomic scale. Herein, we perform extended unbiased all-atom simulations in explicit solvent of a short amphipathic peptide to shed light on the three mechanisms accounting for fibril formation, namely, nucleation via primary and secondary mechanisms, and fibril growth. We find that primary nucleation takes place via the formation of an intermediate state made of two laminated β-sheets oriented perpendicular to each other. The amyloid fibril spine subsequently emerges from the rotation of these β-sheets to account for peptides that are parallel to each other and perpendicular to the main axis of the fibril. Growth of this spine, in turn, takes place via a dock-and-lock mechanism. We find that peptides dock onto the fibril tip either from bulk solution or after diffusing on the fibril surface. The latter docking pathway contributes significantly to populate the fibril tip with peptides. We also find that side chain interactions drive the motion of peptides in the lock phase during growth, enabling them to adopt the structure imposed by the fibril tip with atomic fidelity. Conversely, the docked peptide becomes trapped in a local free energy minimum when docked-conformations are sampled randomly. Our simulations also highlight the role played by nonpolar fibril surface patches in catalyzing and orienting the formation of small cross-β structures. More broadly, our simulations provide important new insights into the pathways and interactions accounting for primary and secondary nucleation as well as the growth of amyloid fibrils.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
sss发布了新的文献求助10
1秒前
4秒前
jessica完成签到,获得积分10
5秒前
aowulan完成签到 ,获得积分10
7秒前
jessica发布了新的文献求助10
9秒前
10秒前
Sid完成签到,获得积分0
14秒前
可久斯基完成签到 ,获得积分10
17秒前
Rjy完成签到 ,获得积分10
20秒前
华仔应助zhoux采纳,获得10
24秒前
兴奋的故事完成签到,获得积分10
25秒前
28秒前
28秒前
Ansaista发布了新的文献求助10
31秒前
Tony完成签到,获得积分10
32秒前
32秒前
夏蓉完成签到,获得积分10
34秒前
Cain发布了新的文献求助10
36秒前
38秒前
enli完成签到,获得积分10
39秒前
Ansaista完成签到,获得积分10
40秒前
南笺完成签到 ,获得积分10
45秒前
coc发布了新的文献求助10
49秒前
斯文败类应助研友_qZ6V1Z采纳,获得10
54秒前
Baraka完成签到,获得积分10
57秒前
Cao完成签到 ,获得积分10
57秒前
xie完成签到 ,获得积分10
1分钟前
zzz完成签到,获得积分10
1分钟前
1分钟前
刘明坤完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
1分钟前
zhoux发布了新的文献求助10
1分钟前
1分钟前
上官若男应助ceeray23采纳,获得20
1分钟前
研友_qZ6V1Z发布了新的文献求助10
1分钟前
1分钟前
星辰大海应助towerman采纳,获得10
1分钟前
xutong de完成签到,获得积分10
1分钟前
qpp完成签到,获得积分10
1分钟前
高分求助中
The Mother of All Tableaux: Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 3000
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
ACSM’s Guidelines for Exercise Testing and Prescription, 12th edition 500
Indomethacinのヒトにおける経皮吸収 400
Phylogenetic study of the order Polydesmida (Myriapoda: Diplopoda) 370
基于可调谐半导体激光吸收光谱技术泄漏气体检测系统的研究 350
Robot-supported joining of reinforcement textiles with one-sided sewing heads 320
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3990012
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3532049
关于积分的说明 11256153
捐赠科研通 3270925
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1805123
邀请新用户注册赠送积分活动 882270
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 809216