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Comprehensive analysis of lactylation-related gene sets and mitochondrial functions in gastric adenocarcinoma: implications for prognosis and therapeutic strategies

免疫疗法 免疫系统 转录组 基因 癌症研究 生物 计算生物学 生物信息学 遗传学 基因表达 免疫学
作者
Xiuxian Yin,Wenge Xing,Yi Nan,Yin Zhou,Yue Chen,Zhiwei Jiang,Chaoqun Ma,Cunbing Xia
出处
期刊:Frontiers in Immunology [Frontiers Media]
卷期号:15 被引量:2
标识
DOI:10.3389/fimmu.2024.1451725
摘要

Gastric adenocarcinoma (STAD) is characterized by high heterogeneity and aggressiveness, leading to poor prognostic outcomes worldwide. This study explored the prognostic significance of lactylation-related gene sets and mitochondrial functions in STAD by integrating large-scale genomic datasets, including TCGA and several GEO datasets. We utilized Spatial transcriptomics and single-cell RNA sequencing to delineate the tumor microenvironment and assess the heterogeneity of cellular responses within the tumor. Additionally, the study identified distinct molecular subtypes within STAD that correspond with unique survival outcomes and immune profiles, enhancing the molecular classification beyond current paradigms. Prognostic models incorporating these molecular markers demonstrated superior predictive capabilities over existing models across multiple validation datasets. Furthermore, our analysis of immune landscapes revealed that variations in lactylation could influence immune cell infiltration and responsiveness, pointing towards novel avenues for tailored immunotherapy approaches. These comprehensive insights provide a foundation for targeted therapeutic strategies and underscore the potential of metabolic and immune modulation in improving STAD treatment outcomes.
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