The kinetics of SARS-CoV-2 infection based on a human challenge study

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作者
Sarafa A. Iyaniwura,Ruy M. Ribeiro,Carolin Zitzmann,Tin Phan,Ruian Ke,Alan S. Perelson
出处
期刊:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America [Proceedings of the National Academy of Sciences]
卷期号:121 (46)
标识
DOI:10.1073/pnas.2406303121
摘要

Studying the early events that occur after viral infection in humans is difficult unless one intentionally infects volunteers in a human challenge study. Here, we use data about severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) in such a study in combination with mathematical modeling to gain insights into the relationship between the amount of virus in the upper respiratory tract and the immune response it generates. We propose a set of dynamic models of increasing complexity to dissect the roles of target cell limitation, innate immunity, and adaptive immunity in determining the observed viral kinetics. We introduce an approach for modeling the effect of humoral immunity that describes a decline in infectious virus after immune activation. We fit our models to viral load and infectious titer data from all the untreated infected participants in the study simultaneously. We found that a power-law with a power

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