Small Molecular Oligopeptides Adorned with Tryptophan Residues as Potent Antitumor Agents: Design, Synthesis, Bioactivity Assay, Computational Prediction, and Experimental Validation

寡肽 色氨酸 化学 计算生物学 组合化学 药理学 生物化学 生物 氨基酸
作者
Hongyu Xu,Tong Li,Qi Wang,Yang Lv,Changhong Sun,Rui Yan,Xiaodan Wu,Yingxue Jin,Zhiqiang Wang
出处
期刊:Journal of Chemical Information and Modeling [American Chemical Society]
标识
DOI:10.1021/acs.jcim.4c01759
摘要

Tryptophan participates in important life activities and is involved in various metabolic processes. The indole and aromatic binuclear ring structure in tryptophan can engage in diverse interactions, including π–π, π–alkyl, hydrogen bonding, cation−π, and CH−π interactions with other side chains and protein targets. These interactions offer extensive opportunities for drug development. In this letter, we have designed and synthesized a series of linear oligopeptides adorned with tryptophan residues and identified their potential targets through artificial intelligence-assisted technology and experimental verification. In vitro bioactivity assays revealed that the oligopeptides containing Gly-Pro-Trp residues exhibited promising antitumor activity by inducing autophagy and apoptosis. The PharmMapper pharmacophore mapping approach, molecular docking, and molecular dynamics simulations together identified poly(ADP-ribose) polymerase 1 (PARP1), an enzyme associated with chromatin regulation, as the potential target for the designed compounds. Experimental biolayer interferometry (BLI) and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) have verified that the oligopeptides could bind with PARP1 and influence PARP1 expression levels. A quantitative structure–activity relationship has been established between the chemical structures of the prepared compounds and their IC50 values. In summary, the research presents a feasible approach for exploring oligopeptide-based antitumor agents.

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
Cold-Drink-Shop完成签到,获得积分10
4秒前
香蕉觅云应助Wang采纳,获得10
6秒前
8秒前
流星雨发布了新的文献求助10
11秒前
forest发布了新的文献求助10
14秒前
Jeffery426完成签到,获得积分10
18秒前
WY完成签到 ,获得积分10
19秒前
baobeikk完成签到 ,获得积分10
23秒前
我就想看看文献完成签到 ,获得积分10
25秒前
Zhou发布了新的文献求助10
26秒前
ylyao完成签到 ,获得积分10
34秒前
林谷雨完成签到 ,获得积分10
39秒前
不吃芹菜完成签到,获得积分10
41秒前
陈炳蓉完成签到,获得积分10
41秒前
xiaowuge完成签到 ,获得积分10
49秒前
刘丰完成签到 ,获得积分10
57秒前
现实的大白完成签到 ,获得积分10
58秒前
cq_2完成签到,获得积分10
58秒前
orixero应助科研通管家采纳,获得10
1分钟前
霁昕完成签到 ,获得积分10
1分钟前
光亮若翠完成签到,获得积分10
1分钟前
onevip完成签到,获得积分10
1分钟前
石子完成签到 ,获得积分10
1分钟前
流浪的鲨鱼完成签到,获得积分20
1分钟前
Jasmineyfz完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
个性的孤风完成签到,获得积分20
1分钟前
ramsey33完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
1分钟前
1分钟前
1分钟前
helinahs完成签到 ,获得积分10
1分钟前
xingxing完成签到 ,获得积分10
1分钟前
YU发布了新的文献求助30
1分钟前
白昼の月完成签到 ,获得积分0
2分钟前
丰富的归尘完成签到 ,获得积分10
2分钟前
forest关注了科研通微信公众号
2分钟前
小慧冲冲冲完成签到,获得积分10
2分钟前
liangguangyuan完成签到 ,获得积分10
2分钟前
高分求助中
Continuum Thermodynamics and Material Modelling 3000
Production Logging: Theoretical and Interpretive Elements 2700
Les Mantodea de Guyane Insecta, Polyneoptera 1000
Structural Load Modelling and Combination for Performance and Safety Evaluation 1000
Conference Record, IAS Annual Meeting 1977 820
電気学会論文誌D(産業応用部門誌), 141 巻, 11 号 510
Typology of Conditional Constructions 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 生物 医学 工程类 有机化学 生物化学 物理 纳米技术 计算机科学 内科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 物理化学 催化作用 量子力学 光电子学 冶金
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3571332
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3141926
关于积分的说明 9444874
捐赠科研通 2843331
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1562830
邀请新用户注册赠送积分活动 731326
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 718524