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Reclassification of [Flavobacterium] ferrugineum as Terrimonas ferruginea gen. nov., comb. nov., and description of Terrimonas lutea sp. nov., isolated from soil

生物 黄杆菌 16S核糖体RNA 拉伤 分类单元 分类学(生物学) 黄杆菌科 微生物学 植物 系统发育树 模式种 核糖体RNA 类型(生物学) 细菌 基因 遗传学 拟杆菌 解剖 生态学 假单胞菌
作者
Cheng-Hui Xie,Akira Yokota
出处
期刊:International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [Microbiology Society]
卷期号:56 (5): 1117-1121 被引量:99
标识
DOI:10.1099/ijs.0.64115-0
摘要

Strain DY T , which was isolated from garden soil in Japan, was subjected to a polyphasic taxonomic study. Sequence analysis of the 16S rRNA gene and the GyrB protein revealed that the closest relative of strain DY T was [ Flavobacterium ] ferrugineum Sickles and Shaw 1934, with 94.8 and 90.1 % similarity, respectively. The two strains had similar chemotaxonomic characteristics, with menaquinone 7 as the major quinone system, 47.2–48.9 mol% DNA G+C content and 15 : 0 iso, 15 : 1 iso, 17 : 0 iso 3-OH and summed feature 3 as the major fatty acids. Based on genotypic and phenotypic characteristics, [ Flavobacterium ] ferrugineum IAM 15098 T could be clearly differentiated from other members of the genus Flavobacterium . Strain DY T and [ Flavobacterium ] ferrugineum IAM 15098 T could be easily distinguished from neighbouring taxa by morphological features (non-motile, non-gliding and non-filamentous single cells). Therefore, it is proposed that [ Flavobacterium ] ferrugineum IAM 15098 T and strain DY T represent two separate species of a new genus, Terrimonas gen. nov., with the names Terrimonas ferruginea comb. nov. (type species; type strain IAM 15098 T =ATCC 13524 T ) and Terrimonas lutea sp. nov. (type strain DY T =IAM 15284 T =CCTCC AB205006 T ), respectively.
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