已入深夜,您辛苦了!由于当前在线用户较少,发布求助请尽量完整地填写文献信息,科研通机器人24小时在线,伴您度过漫漫科研夜!祝你早点完成任务,早点休息,好梦!

A simple flow-cytometry based image processing algorithm for analysing cell-death mechanisms in radiotherapy

碘化丙啶 质心 人口 流式细胞术 程序性细胞死亡 细胞 算法 细胞仪 化学 计算机科学 生物 细胞凋亡 人工智能 分子生物学 医学 生物化学 环境卫生
作者
Santosh Aparanji,Siya Kamat
标识
DOI:10.1117/12.2610061
摘要

In-vitro testing of novel photodynamic therapy/radiotherapy procedures relies heavily on the use of different assays to fully probe various parameters such as cytotoxicity or cell-death pathways. These assays utilise sometimes expensive dyes or antibodies, along with cumbersome sample preparation for flow-cytometry. In this work, we propose a novel image-processing algorithm that uses the flow cytometry plots obtained through a Propidium Iodide based live-dead assay on cancerous and non-cancerous cells to deduce the possible cell-death mechanisms in the process of radiotherapy. Propidium Iodide (PI) is a membrane-impermeable dye taken up by those cells with loss of cell membrane integrity, and does not give any information about the integrity of intracellular components or cellular death pathways. In our novel image-processing algorithm, we determine the centroid of the Forward Scatter (FSC) and the Side Scatter (SSC) cytometer plots of such a PI assay, after suitable clustering. This algorithm is initially applied to an unirradiated control cell population where the FSC centroid gives an estimate of the mean cell size, while the SSC centroid gives the baseline granularity of the cell population. Thereafter, the centroids of the FSC and the SSC plots are calculated for the irradiated cell population, and the deviation in these centroids calculated. These differences are correlated to change in average cell size and denaturation/granularity, and serve as a useful substitute for the cell death mechanism. This can potentially pave the way for in-situ qualitative cell-death analysis in large-volume in-vitro studies in a cost-effective manner.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
2秒前
Mobitz发布了新的文献求助10
3秒前
xiaoxioayixi完成签到 ,获得积分10
3秒前
英俊的铭应助TCMning采纳,获得10
3秒前
雪雪儿发布了新的文献求助10
4秒前
5秒前
5秒前
jcy完成签到,获得积分10
6秒前
青年才俊完成签到,获得积分10
7秒前
tao发布了新的文献求助10
8秒前
Jonathan发布了新的文献求助10
9秒前
10秒前
852应助平淡的藏花采纳,获得10
10秒前
白三发布了新的文献求助10
13秒前
弹剑作歌完成签到,获得积分10
14秒前
糖油果子发布了新的文献求助10
14秒前
英姑应助酷酷的可仁采纳,获得10
15秒前
15秒前
xixi完成签到 ,获得积分20
19秒前
可研发布了新的文献求助10
21秒前
23秒前
Echo完成签到,获得积分10
24秒前
25秒前
学有所成完成签到,获得积分10
26秒前
雪雪儿完成签到,获得积分10
26秒前
wlscj应助jcy采纳,获得20
28秒前
29秒前
Echo发布了新的文献求助10
29秒前
30秒前
小二郎应助yunzheng采纳,获得10
30秒前
Yulanda完成签到,获得积分10
31秒前
xxx完成签到,获得积分10
32秒前
liulu完成签到 ,获得积分10
36秒前
王富贵发布了新的文献求助10
37秒前
37秒前
rainbowbaby发布了新的文献求助10
38秒前
38秒前
Z小姐完成签到 ,获得积分10
38秒前
FashionBoy应助279采纳,获得10
38秒前
英勇的梨愁完成签到 ,获得积分10
39秒前
高分求助中
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Bandwidth Choice for Bias Estimators in Dynamic Nonlinear Panel Models 2000
HIGH DYNAMIC RANGE CMOS IMAGE SENSORS FOR LOW LIGHT APPLICATIONS 1500
Constitutional and Administrative Law 1000
The Social Work Ethics Casebook: Cases and Commentary (revised 2nd ed.). Frederic G. Reamer 800
Vertébrés continentaux du Crétacé supérieur de Provence (Sud-Est de la France) 600
Vertebrate Palaeontology, 5th Edition 530
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 纳米技术 计算机科学 内科学 化学工程 复合材料 物理化学 基因 遗传学 催化作用 冶金 量子力学 光电子学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 5355997
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 4487796
关于积分的说明 13971120
捐赠科研通 4388602
什么是DOI,文献DOI怎么找? 2411155
邀请新用户注册赠送积分活动 1403696
关于科研通互助平台的介绍 1377356