Transcriptome and Metabolomics Integrated Analysis Reveals Terpene Synthesis Genes Controlling Linalool Synthesis in Grape Berries

芳樟醇 代谢组学 转录组 生物 萜烯 基因 化学 计算生物学 食品科学 基因表达 生物化学 精油 生物信息学
作者
Songyu Liu,Bingqi Shan,Xiaomiao Zhou,Wenping Gao,Yaran Liu,Baoqing Zhu,Lei Sun
出处
期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry [American Chemical Society]
卷期号:70 (29): 9084-9094 被引量:15
标识
DOI:10.1021/acs.jafc.2c00368
摘要

In this study, four hybrids from the cross between "Italia" and "Tamina" grapes were chosen to investigate their distinct monoterpenoids patterns and candidate genes involved. Monoterpenoid profiles and transcriptome data were generated at four berry developmental stages. Trans-rose oxide, cis-rose oxide, citronellol, neral, nerol, nerol oxide, geraniol, geranial, geranic acid, and cis-isogeraniol were the dominant compounds in R250 hybrid, while linalool, hotrienol, linalool oxide pyranoside, and cis-furan linalool oxide were the main compounds in R77 hybrid. Six TPS-g subfamily genes were found related with the contents of linalool and its related monoterpenoids by weighted gene coexpression network analysis (WGCNA) and phylogenetic analysis. Among them, TPS59 was cloned and functionally verified by transient overexpression in the leaves of Vitis quinquangularis. Meanwhile, NAC (newGene_195), C2C2-GATA (VIT_15s0021g02510), and bHLH (VIT_14s0128g00110) were selected as candidate transcription factors (TFs) that could regulate the expression of the six TPS-b genes. These data enhanced our understanding on the regulation of monoterpenoid biosynthesis in grapes.
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