SYNGR2 serves as a prognostic biomarker and correlates with immune infiltrates in esophageal squamous cell carcinoma

趋化因子受体 趋化因子 免疫系统 癌症研究 生物标志物 DNA甲基化 生物 CCR2型 甲基化 CXCR4型 下调和上调 肿瘤科 基因 基因表达 医学 免疫学 生物化学
作者
Bin Li,Meiyu Ren,Yuzhen Chen,Yuqi Meng,Tie‐Niu Song,Zhipeng Su,Bo Yang
出处
期刊:Journal of Gene Medicine [Wiley]
卷期号:24 (8) 被引量:1
标识
DOI:10.1002/jgm.3441
摘要

Synaptogyrin-2 (SYNGR2) plays an important role in regulating membrane traffic in non-neuronal cells. However, the role of SYNGR2 in esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) remains unclear.All original data were downloaded from The Cancer Genome Atlas (TCGA) and Gene Expression Omnibus (GEO) databases and integrated via R 3.5.3. SYNGR2 expression was explored in the TCGA and GEO databases. The correlations between SYNGR2 and cancer immune characteristics were analyzed via the TIMER and TISIDB databases.In general, SYNGR2 was predominantly overexpressed and had reference values in the diagnosis and prognostic estimation of ESCC. Upregulated SYNGR2 was associated with poorer overall survival, disease-specific survival and T stage in ESCC. Mechanistically, we identified hub genes that included a total of 38 SYNGR2-related genes, which were tightly associated with the protein polyubiquitination pathway in ESCC patients. SYNGR2 expression was negatively related to the infiltrating levels of T helper cells. SYNGR2 methylation was positively correlated with the expression of chemokines (CCL2 and CXCL12), chemokine receptors (CCR1 and CCR2), immunoinhibitors (CXCL12 and TNFRSF4) and immunostimulators (CSF1R and PDCD1LG2) in ESCC.SYNGR2 may be used as a biomarker for determining prognosis and immune infiltration in ESCC.
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