An automated framework for high-throughput predictions of NMR chemical shifts within liquid solutions

化学位移 溶剂化 密度泛函理论 化学空间 分子动力学 化学 化学种类 化学物理 计算化学 分子 物理化学 药物发现 有机化学 生物化学
作者
Rasha Atwi,Ying Chen,Kee Sung Han,Karl T. Mueller,Vijayakumar Murugesan,Nav Nidhi Rajput
出处
期刊:Nature Computational Science [Springer Nature]
卷期号:2 (2): 112-122 被引量:6
标识
DOI:10.1038/s43588-022-00200-9
摘要

Identifying stable speciation in multi-component liquid solutions is fundamentally important to areas from electrochemistry to organic chemistry and biomolecular systems. Here we introduce a fully automated, high-throughput computational framework for the accurate prediction of stable species in liquid solutions by computing the nuclear magnetic resonance (NMR) chemical shifts. The framework automatically extracts and categorizes hundreds of thousands of atomic clusters from classical molecular dynamics simulations, identifies the most stable species in solution and calculates their NMR chemical shifts via density functional theory calculations. Additionally, the framework creates a database of computed chemical shifts for liquid solutions across a wide chemical and parameter space. We compare our computational results to experimental measurements for magnesium bis(trifluoromethanesulfonyl)imide Mg(TFSI)2 salt in dimethoxyethane solvent. Our analysis of the Mg2+ solvation structural evolutions reveals key factors that influence the accuracy of NMR chemical shift predictions in liquid solutions. Furthermore, we show how the framework reduces the performance of over 300 13C and 600 1H density functional theory chemical shift predictions to a single submission procedure. A fully automated, high-throughput computational framework is presented to predict stable species in liquid solutions. This framework combines density functional theory with classical molecular dynamics simulations to compute the NMR chemical shifts.
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