Exploring Coding Sequence Length Distributions Across TaxonomicKingdoms Based on Maximum Information Principle

编码(社会科学) 序列(生物学) 编码区 王国 进化生物学 生物 计算生物学 遗传学 统计 数学 古生物学 基因
作者
Sebu Aboma Temesgen,Bakanina Kissanga Grace-Mercure,Basharat Ahmad,Yan-Ting Jin,Li Liu,Hao Lin
出处
期刊:Current Bioinformatics [Bentham Science Publishers]
卷期号:20
标识
DOI:10.2174/0115748936355149250108083111
摘要

Background: Genetic information about organisms' traits is stored and encoded in deoxyribonucleic acid (DNA) sequences. The fundamental inquiry into the storage mechanisms of this genetic information within genomes has long been of interest to geneticists and biophysicists. Objective: The objective of this study was to investigate the distribution of coding sequence (CDS) lengths in species genomes across different kingdoms. Methods: In this study, we used the maximum entropy principle and the gamma distribution model based on a comprehensive dataset including viruses, archaea, bacteria, and eukaryote species Results: Our study result revealed unique patterns in CDS length distributions among kingdoms and CDS lengths exhibit a right-skewed distribution, with varying preferences among kingdoms. Eukaryotes displayed bimodal distributions, with CDS sequences longer than those of prokaryotes. Fitting the gamma distribution model revealed differences in shape and scale parameters among kingdoms, with eukaryotes exhibiting larger scale parameters, indicating longer CDS sequences. Additionally, analysis of moments highlighted the complexity of eukaryotic genomes relative to prokaryotes. Conclusion: This study result deepens our understanding of genome evolution and provides valuable insights for biological research.Conclusion: This study result deepens our understanding of genome evolution and provides valuable insights for biological research.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
C瓜菌发布了新的文献求助10
刚刚
玉面唐衣发布了新的文献求助10
刚刚
刚刚
1秒前
Nole应助甜馨采纳,获得10
1秒前
Nole应助甜馨采纳,获得10
1秒前
帆帆羊发布了新的文献求助10
1秒前
竹前家庆完成签到,获得积分10
2秒前
2秒前
GeYX完成签到,获得积分10
3秒前
3秒前
3秒前
3秒前
4秒前
优雅柏柳发布了新的文献求助10
5秒前
5秒前
SciGPT应助文静的笑槐采纳,获得10
5秒前
6秒前
iyoi完成签到,获得积分10
7秒前
机灵夜云发布了新的文献求助10
7秒前
7秒前
eason发布了新的文献求助10
7秒前
eason发布了新的文献求助10
8秒前
Tao发布了新的文献求助10
8秒前
8秒前
9秒前
祝一刀发布了新的文献求助10
9秒前
踏实短靴发布了新的文献求助10
9秒前
9秒前
10秒前
11秒前
frank完成签到 ,获得积分10
11秒前
核桃发布了新的文献求助20
11秒前
13秒前
13秒前
老牛鼓励看文献完成签到,获得积分10
14秒前
eason发布了新的文献求助10
14秒前
eason发布了新的文献求助10
14秒前
eason发布了新的文献求助10
14秒前
eason发布了新的文献求助10
14秒前
高分求助中
Markov Chain Monte Carlo 10000
(应助此贴封号)【重要!!请各用户(尤其是新用户)详细阅读】【科研通的精品贴汇总】 10000
Common Foundations of American and East Asian Modernisation: From Alexander Hamilton to Junichero Koizumi 1500
Advanced Weaponeering Fourth Edition, Volume 2 1000
悉尼大学博士学位论文,题目:Modelling and testing of one-sided stitched laminated composites. 作者:Kristopher P. Plain 700
Matrix Methods in Data Mining and Pattern Recognition Second Edition 610
Curating Socialism: A Handbook of International Art Exhibitions 1947-1989 550
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 纳米技术 工程类 有机化学 化学工程 生物化学 计算机科学 内科学 物理 复合材料 催化作用 细胞生物学 无机化学 光电子学 物理化学 电极 基因
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 7510372
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 9098964
关于积分的说明 19419435
捐赠科研通 7117438
什么是DOI,文献DOI怎么找? 3252850
关于科研通互助平台的介绍 2421706
邀请新用户注册赠送积分活动 2239112