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Targeted next generation sequencing identified a novel mutation in MYO7A causing Usher syndrome type 1 in an Iranian consanguineous pedigree

Usher综合征 桑格测序 遗传学 遗传异质性 色素性视网膜炎 先证者 基因座(遗传学) 无义突变 医学 DNA测序 外显子组测序 常染色体隐性性状 疾病基因鉴定 基因 生物 突变 错义突变 表型
作者
Daniz Kooshavar,Masoumeh Razipour,M Movasat,Mohammad Keramatipour
出处
期刊:International Journal of Pediatric Otorhinolaryngology [Elsevier]
卷期号:104: 10-13 被引量:7
标识
DOI:10.1016/j.ijporl.2017.10.022
摘要

Usher syndrome (USH) is characterized by congenital hearing loss and retinitis pigmentosa (RP) with a later onset. It is an autosomal recessive trait with clinical and genetic heterogeneity which makes the molecular diagnosis much difficult. In this study, we introduce a pedigree with two affected members with USH type 1 and represent a cost and time effective approach for genetic diagnosis of USH as a genetically heterogeneous disorder.Target region capture in the genes of interest, followed by next generation sequencing (NGS) was used to determine the causative mutations in one of the probands. Then segregation analysis in the pedigree was conducted using PCR-Sanger sequencing.Targeted NGS detected a novel homozygous nonsense variant c.4513G > T (p.Glu1505Ter) in MYO7A. The variant is segregating in the pedigree with an autosomal recessive pattern.In this study, a novel stop gained variant c.4513G > T (p.Glu1505Ter) in MYO7A was found in an Iranian pedigree with two affected members with USH type 1. Bioinformatic as well as pedigree segregation analyses were in line with pathogenic nature of this variant. Targeted NGS panel was showed to be an efficient method for mutation detection in hereditary disorders with locus heterogeneity.
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