RNAVirHost: a machine learning-based method for predicting hosts of RNA viruses through viral genomes.

基因组 计算生物学 核糖核酸 生物 病毒学 计算机科学 人工智能 遗传学 基因
作者
Guowei Chen,Jing‐Zhe Jiang,Yanni Sun
出处
期刊:GigaScience [Oxford University Press]
卷期号:13
标识
DOI:10.1093/gigascience/giae059
摘要

The high-throughput sequencing technologies have revolutionized the identification of novel RNA viruses. Given that viruses are infectious agents, identifying hosts of these new viruses carries significant implications for public health and provides valuable insights into the dynamics of the microbiome. However, determining the hosts of these newly discovered viruses is not always straightforward, especially in the case of viruses detected in environmental samples. Even for host-associated samples, it is not always correct to assign the sample origin as the host of the identified viruses. The process of assigning hosts to RNA viruses remains challenging due to their high mutation rates and vast diversity.
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