Omadacycline dihydrate, C29H40N4O7·2H2O, from X-ray powder diffraction data

氢键 结晶学 草酰胺 化学 X射线晶体学 利乐 晶体结构 互变异构体 X射线 粘结长度 衍射 分子 立体化学 药物化学 物理 有机化学 光学 量子力学
作者
James A. Kaduk,Nicholas C. Boaz,Stacy Gates-Rector,Amy M. Gindhart,Thomas N. Blanton
出处
期刊:Acta Crystallographica Section E: Crystallographic Communications [International Union of Crystallography]
卷期号:80 (3) 被引量:1
标识
DOI:10.1107/s2056989024001403
摘要

The crystal structure of the title compound {systematic name: (4 S ,4a S ,5a R ,12a R )-4,7-bis(dimethylamino)-9-[(2,2-dimethylpropylamino)methyl]-1,10,11,12a-tetrahydroxy-3,12-dioxo-4a,5,5a,6-tetrahydro-4 H -tetracene-2-carboxamide dihydrate, C 29 H 40 N 4 O 7 ·2H 2 O} has been solved and refined using synchrotron X-ray powder diffraction data: it crystallizes in space group R 3 with a = 24.34430 (7), c = 14.55212 (4) Å, V = 7468.81 (2) Å 3 and Z = 9. Most of the hydrogen bonds are intramolecular, but two classical N—H...O intermolecular hydrogen bonds (along with probable weak C—H...O and C—H...N hydrogen bonds) link the molecules into a three-dimensional framework. The framework contains voids, which contain disordered water molecules. Keto–enol tautomerism is apparently important in this molecule, and the exact molecular structure is ambiguous.

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