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Folded-chain structure of cellulose II suggested by molecular dynamics simulation

化学 分子动力学 纤维素 晶体结构 氢键 结晶学 结晶 链条(单位) Crystal(编程语言) 侧链 测试表 分子 蛋白质结构 计算化学 有机化学 聚合物 物理 生物化学 程序设计语言 计算机科学 天文
作者
Chihiro Yamane,Hitomi Miyamoto,Daichi Hayakawa,Kazuyoshi Ueda
出处
期刊:Carbohydrate Research [Elsevier BV]
卷期号:379: 30-37 被引量:30
标识
DOI:10.1016/j.carres.2013.06.012
摘要

We investigated the possibility of a folded-chain crystal of the cellulose II polymorph by molecular dynamics (MD) simulation. The molecular direction of cellulose chains in cellulose II is anti-parallel, which allows the crystal to have folded-chain packing. It is impossible for cellulose I to form such a structure due to its parallel up assembly. The folded-chain crystal of the cellulose II polymorph was suggested based on the following results: (1) the glucose residue with boat and skew boat ring conformations enabled the cellulose chain to form a hairpin turn; (2) the lattice parameters of the folded-chain crystal and original crystal were almost the same (deviations in the a, b, and γ parameters of both crystals were within 3%); (3) the folded-chain molecular sheet was as stable in a water medium as the extended-chain molecular sheet, and structural parameters such as the hydrogen bonding system and side chain conformation of both molecular sheets were almost the same, indicating that the folded-chain molecular sheet is an initial structure during crystallization of the folded-chain crystal.
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