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Density Functional Computations on 6-Aminouracil: Effect of Amino Group in the 6th Position on the Watson–Crick Base Pair Uridine–Adenosine

化学 尿苷 脱氧腺苷 结晶学 计算化学 密度泛函理论 立体化学 拉曼光谱 碱基对 核酸的分子结构:脱氧核糖核酸的一种结构 分子 偶极子 腺苷 DNA 有机化学 物理 核糖核酸 量子力学 生物化学 基因
作者
M. Alcolea Palafox,V. K. Rastogi
出处
期刊:Australian Journal of Chemistry [CSIRO Publishing]
卷期号:69 (8): 881-881 被引量:2
标识
DOI:10.1071/ch15793
摘要

The predicted infrared and Raman spectra of 6-aminouracil in the solid state by density functional theory methods were analyzed and compared with the experimental spectra. The effect of amino substitution in the sixth position of uridine on the stability of the Watson–Crick (WC) base pairs with deoxyadenosine was evaluated. Different WC pairs of 5-aminouridine, 6-aminouridine, and uridine with deoxyadenosine were simulated, and the counterpoise-corrected interaction energies were determined. 6-Aminouridine produces a stronger WC pair than that involving uridine, and its high dipole moment facilitates interaction with water molecules.

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