Next-generation sequencing technology reveals the viruses carried by poultry in the live poultry market of Guangdong, China

生物 冠状病毒科 丰度(生态学) 病毒 病毒学 2019年冠状病毒病(COVID-19) 生态学 医学 疾病 病理 传染病(医学专业)
作者
Yang Zhou,Yuxin Zhang,Weixin Jia
出处
期刊:Veterinary Microbiology [Elsevier]
卷期号:295: 110136-110136
标识
DOI:10.1016/j.vetmic.2024.110136
摘要

This study aimed to analyze the species and abundance of viruses carried by avian species in live poultry markets. In 2022, we collected 196 bird samples from two representative live poultry markets in Guangdong, China, of which 147 were randomly selected for metatranscriptome sequencing to construct a metatranscriptome library. This analysis yielded 17 viral families. Statistical analysis of the virus abundance of the six libraries showed that Picornaviridae, Retroviridae, Coronaviridae, and Othomyxoviridae were more abundant in the J1, J2, and J3 libraries, and Coronaviridae, Retroviridae, and Faviviridae were more abundant in the Y1, Y2, and E1 libraries. Finally, samples were screened using nested PCR and three viruses were identified. The positive results combined with high-throughput sequencing abundance data showed a positive correlation between virus abundance and the number of positive samples. This study provides scientific data to support the diagnosis and prevention of avian viral diseases.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
咚咚发布了新的文献求助10
3秒前
LIN发布了新的文献求助10
3秒前
4秒前
田様应助wang采纳,获得10
7秒前
8秒前
淡定的半莲完成签到 ,获得积分10
8秒前
东方天奇发布了新的文献求助10
9秒前
fangzhang发布了新的文献求助10
10秒前
风中的丝袜完成签到,获得积分10
10秒前
shinysparrow应助danrushui777采纳,获得200
11秒前
巫马尔槐发布了新的文献求助10
11秒前
乖拉完成签到,获得积分10
13秒前
14秒前
14秒前
15秒前
15秒前
充电宝应助wen采纳,获得10
16秒前
whh完成签到,获得积分10
16秒前
16秒前
17秒前
共享精神应助bvh采纳,获得10
18秒前
18秒前
清风发布了新的文献求助10
19秒前
dfsf发布了新的文献求助10
19秒前
20秒前
20秒前
20秒前
未晞发布了新的文献求助10
20秒前
科研的POWER完成签到,获得积分10
20秒前
mc关闭了mc文献求助
21秒前
Breathe发布了新的文献求助10
22秒前
华仔应助科研探索者采纳,获得10
24秒前
24秒前
石头发布了新的文献求助10
24秒前
24秒前
希望天下0贩的0应助咚咚采纳,获得10
25秒前
yyyq0721完成签到 ,获得积分10
26秒前
26秒前
巫马尔槐发布了新的文献求助10
26秒前
顺利白柏完成签到,获得积分10
27秒前
高分求助中
Kinetics of the Esterification Between 2-[(4-hydroxybutoxy)carbonyl] Benzoic Acid with 1,4-Butanediol: Tetrabutyl Orthotitanate as Catalyst 1000
The Young builders of New china : the visit of the delegation of the WFDY to the Chinese People's Republic 1000
Rechtsphilosophie 1000
Handbook of Qualitative Cross-Cultural Research Methods 600
Chen Hansheng: China’s Last Romantic Revolutionary 500
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 500
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3139150
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2790129
关于积分的说明 7793840
捐赠科研通 2446527
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1301209
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 626124
版权声明 601109