Integrated analysis of miRNA-mRNA regulatory network and functional verification of miR-338-3p in coronary heart disease

小RNA 下调和上调 生物 生物标志物 疾病 冠心病 信使核糖核酸 癌症研究 RNA干扰 基因沉默 生物信息学 内科学 医学 基因 遗传学 核糖核酸
作者
Jie Qi,Wenqi Han,Nier Zhong,Qiling Gou,Chaofeng Sun
出处
期刊:Functional & Integrative Genomics [Springer Nature]
卷期号:23 (1) 被引量:10
标识
DOI:10.1007/s10142-022-00941-w
摘要

Coronary heart disease is a cardiovascular disease with high morbidity and mortality. Although great progress has been made in treatment, the prognosis is still very poor. Therefore, this project aims to screen potential diagnostic markers and therapeutic targets related to the progression of coronary heart disease. A total of 94 overlapping differentially expressed mRNAs and 70 differentially expressed miRNAs were identified from GSE20681, GSE12288, GSE49823, and GSE105449. Through a series of bioinformatics methods and experiment, we obtained 5 core miRNA-mRNA regulatory pairs, and selected miR-338-3p/RPS23 for functional analysis. Moreover, we found that RPS23 directly targets miR-338-3p by dual luciferase assay, western, and qPCR. And the expression of miR-338-3p and RPS23 is negatively correlated. The AUC value of miR-338-3p is 0.847. Downregulation of miR-338-3p can significantly inhibit the proliferation and migration of HUVEC. On the contrary, overexpression of miR-338-3p promoted the proliferation and migration of HUVEC. In addition, the interference of RPS23 expression can reverse the regulation of miR-338-3p on HUVEC proliferation. In conclusion, miR-338-3p/RPS23 may be involved in the progression of coronary heart disease, and miR-338-3p may be a diagnostic biomarker and therapeutic target for coronary heart disease.
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