Dynamic Docking-Assisted Engineering of Hydrolases for Efficient PET Depolymerization

解聚 角质酶 对苯二甲酸 对接(动物) 聚酯纤维 乙二醇 化学 催化作用 单体 乙烯 配体(生物化学) 组合化学 有机化学 聚合物 生物化学 医学 护理部 受体
作者
Yi Zheng,Qingbin Li,Pan Liu,Yingbo Yuan,Longyang Dian,Qian Wang,Quanfeng Liang,Tianyuan Su,Qingsheng Qi
出处
期刊:ACS Catalysis 卷期号:14 (5): 3627-3639 被引量:9
标识
DOI:10.1021/acscatal.4c00400
摘要

Poly(ethylene terephthalate) (PET) is the most abundant polyester plastic and is causing serious environmental pollution. Rapid biological depolymerization of PET waste at a large scale requires powerful engineered enzymes with excellent performance. Here, we designed a computational strategy to analyze the ligand affinity energy of enzymes to PET chains by molecular docking with the dynamic protein conformations, named affinity analysis based on dynamic docking (ADD). After three rounds of protein engineering assisted by ADD, we drastically enhanced the PET-depolymerizing activity of leaf-branch-compost cutinase (LCC). The best variant LCC-A2 depolymerized >90% of the pretreated, postconsumer PET waste into corresponding monomers within 3.3 h at 78 °C, and over 99% of the products was terminal depolymerization products (terephthalic acid and ethylene glycol), representing the fastest PET depolymerization rate reported to date in the bioreactor under optimal condition. Structural analysis revealed interesting features that improved the ligand affinity and catalytic performance. In conclusion, the proposed strategy and engineered variants represent a substantial advancement of the biological circular economy for PET.
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