Antimicrobial peptides recognition using weighted physicochemical property encoding

抗菌肽 抗菌剂 财产(哲学) 人工智能 编码(内存) 计算机科学 计算生物学 模式识别(心理学) 生物 化学 微生物学 认识论 哲学
作者
S Na,Dhammika Leshan Wannigama,Thammakorn Saethang
出处
期刊:Journal of Bioinformatics and Computational Biology [Imperial College Press]
卷期号:21 (02) 被引量:2
标识
DOI:10.1142/s0219720023500063
摘要

Antimicrobial resistance is a major public health concern. Antimicrobial peptides (AMPs) are one of the host defense mechanisms responding efficiently against multidrug-resistant microbes. Since the process of screening AMPs from a large number of peptides is still high-priced and time-consuming, the development of a precise and rapid computer-aided tool is essential for preliminary AMPs selection ahead of laboratory experiments. In this study, we proposed AMPs recognition models using a new peptide encoding method called amino acid index weight (AAIW). Four AMPs recognition models including antimicrobial, antibacterial, antiviral, and antifungal were trained based on datasets combined from the DRAMP and other published databases. These models achieved high performance compared to the preceding AMPs recognition models when evaluated on two independent test sets. All four models yielded over 93% in accuracy and 0.87 in Matthew's correlation coefficient (MCC). An online AMPs recognition server is accessible at https://amppred-aaiw.com.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
莫x莫完成签到 ,获得积分10
刚刚
bubble完成签到,获得积分10
1秒前
1秒前
万能图书馆应助sl采纳,获得10
1秒前
河丫应助sl采纳,获得10
1秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
2秒前
科研人发布了新的文献求助10
2秒前
2秒前
魏莱关注了科研通微信公众号
3秒前
dd发布了新的文献求助10
4秒前
yifan92完成签到,获得积分10
5秒前
6秒前
灵巧的孤容完成签到,获得积分10
7秒前
袁翰将军发布了新的文献求助10
7秒前
a雪橙完成签到 ,获得积分10
9秒前
超帅的碱完成签到,获得积分10
9秒前
10秒前
陈大海完成签到,获得积分20
10秒前
LaTeXer给积极行天的求助进行了留言
10秒前
白斯特完成签到,获得积分10
11秒前
科研混子完成签到,获得积分10
11秒前
听雨完成签到 ,获得积分10
11秒前
jianglili完成签到 ,获得积分10
11秒前
思源应助王云骢采纳,获得10
12秒前
等待的航空完成签到 ,获得积分10
13秒前
顾矜应助乔安采纳,获得10
13秒前
雪ノ下詩乃完成签到,获得积分10
14秒前
神外之城发布了新的文献求助80
14秒前
科研人完成签到,获得积分10
16秒前
莫友安完成签到 ,获得积分10
16秒前
大个应助迅速曼冬采纳,获得10
17秒前
热心市民小红花应助阿湫采纳,获得10
18秒前
快乐战神没烦恼完成签到,获得积分10
18秒前
顾矜应助魏莱采纳,获得10
18秒前
SYLH应助Rollei采纳,获得10
18秒前
19秒前
dd完成签到,获得积分20
19秒前
刻苦羽毛完成签到,获得积分10
20秒前
小粒橙完成签到 ,获得积分10
21秒前
lulu完成签到,获得积分10
24秒前
高分求助中
【提示信息,请勿应助】关于scihub 10000
Les Mantodea de Guyane: Insecta, Polyneoptera [The Mantids of French Guiana] 3000
徐淮辽南地区新元古代叠层石及生物地层 3000
The Mother of All Tableaux: Order, Equivalence, and Geometry in the Large-scale Structure of Optimality Theory 3000
Global Eyelash Assessment scale (GEA) 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 550
Research on Disturbance Rejection Control Algorithm for Aerial Operation Robots 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 4038446
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3576149
关于积分的说明 11374627
捐赠科研通 3305875
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1819354
邀请新用户注册赠送积分活动 892680
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 815048