Discovery of Cysteine Carboxyalkylations by Real-Time Isotopic Signature Targeted Profiling

化学 鸟枪蛋白质组学 蛋白质组学 猎枪 质谱法 仿形(计算机编程) 计算生物学 半胱氨酸 数据采集 色谱法 生物化学 计算机科学 生物 操作系统 基因
作者
Guogeng Jia,Y Liu,Feng Tianyu,Zixuan Zhang,Huan Tang,Fan Yang,Zhenchen Tang,Weidi Xiao,Ying Chen,Jinjun Gao,Chu Wang
出处
期刊:Journal of the American Chemical Society [American Chemical Society]
标识
DOI:10.1021/jacs.4c16183
摘要

Data-dependent acquisition (DDA) is widely applied in shotgun proteomics. However, restricted by the scanning speed of mass spectrometry (MS) instruments, it remains challenging for DDA to directly detect peptides with low abundance. Herein, we developed a real-time targeted MS data acquisition method, "isoSTAR", which identifies target peptides by their unique isotopic signatures during the stage of full-MS scanning and subjects them to targeted MS/MS scans immediately. The method showed dramatic improvement in sensitivity in identifying target peptides with low abundance compared to traditional MS acquisition methods. Using this method, we discovered a series of carboxyalkylations on cysteines during fatty acid metabolism and verified their modification structures using synthetic peptide standards. We envision that isoSTAR will become a powerful and versatile tool to enhance shotgun proteomics applications in profiling protein-centric modifications.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
刚刚
2秒前
3秒前
4秒前
星曳发布了新的文献求助10
4秒前
7秒前
优雅醉山发布了新的文献求助10
7秒前
8秒前
迟大猫应助YanChengHan采纳,获得10
10秒前
ZengJuan发布了新的文献求助10
10秒前
11秒前
zz完成签到,获得积分10
11秒前
满意沛槐完成签到 ,获得积分10
11秒前
愉快的真发布了新的文献求助50
11秒前
zzh完成签到,获得积分20
13秒前
神羊发布了新的文献求助10
14秒前
zz发布了新的文献求助10
14秒前
星曳完成签到,获得积分10
14秒前
迟大猫应助Han采纳,获得10
14秒前
<7完成签到,获得积分10
14秒前
14秒前
15秒前
隐形曼青应助夜月残阳采纳,获得10
16秒前
16秒前
16秒前
鞑靼完成签到 ,获得积分10
18秒前
FashionBoy应助guojingjing采纳,获得10
19秒前
20秒前
uietoo发布了新的文献求助10
20秒前
20秒前
11发布了新的文献求助10
21秒前
MShou发布了新的文献求助10
21秒前
sciDoge完成签到,获得积分10
21秒前
群山发布了新的文献求助10
22秒前
李爱国应助小段采纳,获得10
22秒前
zhuj11应助ZengJuan采纳,获得10
23秒前
mokmok发布了新的文献求助10
24秒前
我是老大应助优雅醉山采纳,获得10
24秒前
1111完成签到 ,获得积分10
25秒前
彻底发布了新的文献求助30
26秒前
高分求助中
Continuum Thermodynamics and Material Modelling 3000
Production Logging: Theoretical and Interpretive Elements 2700
Les Mantodea de Guyane Insecta, Polyneoptera 1000
Structural Load Modelling and Combination for Performance and Safety Evaluation 1000
Conference Record, IAS Annual Meeting 1977 820
電気学会論文誌D(産業応用部門誌), 141 巻, 11 号 510
Typology of Conditional Constructions 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 生物 医学 工程类 有机化学 生物化学 物理 纳米技术 计算机科学 内科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 物理化学 催化作用 量子力学 光电子学 冶金
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3570690
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3141392
关于积分的说明 9442819
捐赠科研通 2842740
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1562418
邀请新用户注册赠送积分活动 731079
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 718290