Amino acid transporter (AAT) gene family in Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn.): Characterization, expression analysis and functional prediction

苦荞 生物 基因 荞麦属 系统发育树 非生物胁迫 氨基酸 遗传学 非生物成分 植物 生物化学 古生物学 芦丁 抗氧化剂
作者
Yang Yang,Xinfang Wang,Jie Zheng,Yihan Men,Yijuan Zhang,Longlong Liu,Yuanhuai Han,Siyu Hou,Zhaoxia Sun
出处
期刊:International Journal of Biological Macromolecules [Elsevier]
卷期号:217: 330-344 被引量:5
标识
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2022.07.059
摘要

Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn., TB) is an ancient minor crop and an important food source for humans to supplement nutrients such as flavonoids and essential amino acids. Amino acid transporters (AATs) play critical roles in plant growth and development through the transport of amino acids. In this study, 104 AATs were identified in TB genome and divided into 11 subfamilies by phylogenetic relationships. Tandem and segmental duplications promoted the expansion of FtAAT gene family, and the variations of gene sequence, protein structure and expression pattern were the main reasons for the functional differentiation of FtAATs. Based on RNA-seq and qRT-PCR, the expression patterns of FtAATs in different tissues and under different abiotic stresses were analyzed, and several candidate FtAATs that might affect grain development and response to abiotic stresses were identified, such as FtAAP12 and FtCAT7. Finally, combined with the previous studies, the expression patterns and phylogenetic relationships of AATs in multiple species, the functions of multiple high-confidence FtAAT genes were predicted, and the schematic diagram of FtAATs in TB was initially drawn. Overall, this work provided a framework for further functional analysis of FtAAT genes and important clues for the improvement of TB quality and stress resistance.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
神勇毛衣发布了新的文献求助10
刚刚
随机子应助moonlight采纳,获得10
1秒前
ww完成签到 ,获得积分10
5秒前
cg发布了新的文献求助10
6秒前
6秒前
小辞芙芙发布了新的文献求助30
7秒前
化石吟完成签到,获得积分10
7秒前
10秒前
赘婿应助XSY采纳,获得10
10秒前
10秒前
机灵鸡应助问问问采纳,获得10
11秒前
冷酷愚志完成签到,获得积分10
11秒前
sgssm完成签到,获得积分10
11秒前
搞怪网络发布了新的文献求助10
11秒前
领导范儿应助cg采纳,获得10
13秒前
13秒前
优秀含羞草完成签到,获得积分10
15秒前
15秒前
15秒前
1234发布了新的文献求助10
15秒前
李小小发布了新的文献求助20
15秒前
16秒前
我是老大应助Felicity采纳,获得10
18秒前
Ava应助戴衡霞采纳,获得10
18秒前
搜集达人应助Tantantan采纳,获得10
19秒前
爆米花应助现实的奇异果采纳,获得10
20秒前
dgfhg发布了新的文献求助10
20秒前
小可爱完成签到,获得积分10
20秒前
乐乐应助迅速的鹤采纳,获得100
20秒前
kk完成签到,获得积分10
20秒前
20秒前
21秒前
香蕉觅云应助ffff采纳,获得10
21秒前
22秒前
23秒前
彦祖i学术完成签到,获得积分10
23秒前
花生王子完成签到 ,获得积分10
25秒前
27秒前
笑点低的火龙果完成签到,获得积分20
28秒前
28秒前
高分求助中
Spray / Wall-interaction Modelling by Dimensionless Data Analysis 2000
Evolution 3rd edition 1500
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
ALA生合成不全マウスでの糖代謝異常の分子機構解析 520
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3187770
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2837531
关于积分的说明 8015469
捐赠科研通 2500157
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1334772
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 637295
邀请新用户注册赠送积分活动 605251