Amino acid transporter (AAT) gene family in Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn.): Characterization, expression analysis and functional prediction

苦荞 生物 基因 荞麦属 系统发育树 非生物胁迫 氨基酸 遗传学 非生物成分 植物 生物化学 古生物学 芦丁 抗氧化剂
作者
Yang Yang,Xinfang Wang,Jie Zheng,Yihan Men,Yijuan Zhang,Longlong Liu,Yuanhuai Han,Siyu Hou,Zhaoxia Sun
出处
期刊:International Journal of Biological Macromolecules [Elsevier]
卷期号:217: 330-344 被引量:5
标识
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2022.07.059
摘要

Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn., TB) is an ancient minor crop and an important food source for humans to supplement nutrients such as flavonoids and essential amino acids. Amino acid transporters (AATs) play critical roles in plant growth and development through the transport of amino acids. In this study, 104 AATs were identified in TB genome and divided into 11 subfamilies by phylogenetic relationships. Tandem and segmental duplications promoted the expansion of FtAAT gene family, and the variations of gene sequence, protein structure and expression pattern were the main reasons for the functional differentiation of FtAATs. Based on RNA-seq and qRT-PCR, the expression patterns of FtAATs in different tissues and under different abiotic stresses were analyzed, and several candidate FtAATs that might affect grain development and response to abiotic stresses were identified, such as FtAAP12 and FtCAT7. Finally, combined with the previous studies, the expression patterns and phylogenetic relationships of AATs in multiple species, the functions of multiple high-confidence FtAAT genes were predicted, and the schematic diagram of FtAATs in TB was initially drawn. Overall, this work provided a framework for further functional analysis of FtAAT genes and important clues for the improvement of TB quality and stress resistance.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
爆米花应助hhan采纳,获得10
2秒前
好烦呀发布了新的文献求助10
2秒前
海阔光明发布了新的文献求助10
3秒前
Lucas应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
星辰大海应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
在水一方应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
4秒前
小二郎应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
simpleton发布了新的文献求助10
4秒前
乐乐应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
酷波er应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
科研通AI2S应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
4秒前
打打应助科研通管家采纳,获得10
4秒前
5秒前
6秒前
青衍应助折光采纳,获得10
7秒前
7秒前
7秒前
情怀应助zhangxinyu采纳,获得10
8秒前
8秒前
8秒前
木头发布了新的文献求助10
11秒前
坦率邪欢发布了新的文献求助10
12秒前
任性的卿发布了新的文献求助10
13秒前
KK完成签到,获得积分10
14秒前
14秒前
16秒前
zhangxinyu发布了新的文献求助10
19秒前
20秒前
后笑晴发布了新的文献求助10
20秒前
dingxin完成签到,获得积分20
23秒前
25秒前
坚定伊完成签到,获得积分10
26秒前
优雅的飞珍关注了科研通微信公众号
26秒前
张有志完成签到,获得积分10
28秒前
dingxin发布了新的文献求助30
28秒前
传奇3应助zzz采纳,获得50
29秒前
高分求助中
Evolution 3rd edition 1500
保险藏宝图 1000
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3184406
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2834716
关于积分的说明 8000982
捐赠科研通 2497107
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1332655
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 636631
邀请新用户注册赠送积分活动 603979