Amino acid transporter (AAT) gene family in Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn.): Characterization, expression analysis and functional prediction

苦荞 生物 基因 荞麦属 系统发育树 非生物胁迫 氨基酸 遗传学 非生物成分 植物 生物化学 古生物学 芦丁 抗氧化剂
作者
Yang Yang,Xinfang Wang,Jie Zheng,Yihan Men,Yijuan Zhang,Longlong Liu,Yuanhuai Han,Siyu Hou,Zhaoxia Sun
出处
期刊:International Journal of Biological Macromolecules [Elsevier]
卷期号:217: 330-344 被引量:5
标识
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2022.07.059
摘要

Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn., TB) is an ancient minor crop and an important food source for humans to supplement nutrients such as flavonoids and essential amino acids. Amino acid transporters (AATs) play critical roles in plant growth and development through the transport of amino acids. In this study, 104 AATs were identified in TB genome and divided into 11 subfamilies by phylogenetic relationships. Tandem and segmental duplications promoted the expansion of FtAAT gene family, and the variations of gene sequence, protein structure and expression pattern were the main reasons for the functional differentiation of FtAATs. Based on RNA-seq and qRT-PCR, the expression patterns of FtAATs in different tissues and under different abiotic stresses were analyzed, and several candidate FtAATs that might affect grain development and response to abiotic stresses were identified, such as FtAAP12 and FtCAT7. Finally, combined with the previous studies, the expression patterns and phylogenetic relationships of AATs in multiple species, the functions of multiple high-confidence FtAAT genes were predicted, and the schematic diagram of FtAATs in TB was initially drawn. Overall, this work provided a framework for further functional analysis of FtAAT genes and important clues for the improvement of TB quality and stress resistance.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
君君君完成签到 ,获得积分10
刚刚
刚刚
hygge发布了新的文献求助10
2秒前
慕青应助会画画的猫咪采纳,获得10
2秒前
fandada发布了新的文献求助10
2秒前
松帅完成签到,获得积分20
2秒前
wangayting发布了新的文献求助10
2秒前
上官若男应助孤独的匕采纳,获得10
2秒前
3秒前
talpionchen完成签到,获得积分10
3秒前
优美的棉花糖完成签到,获得积分10
3秒前
feiCheung发布了新的文献求助10
3秒前
刘丰丰发布了新的文献求助10
4秒前
4秒前
4秒前
慕青应助CDY采纳,获得10
4秒前
4秒前
111222完成签到,获得积分10
5秒前
华仔应助西子阳采纳,获得10
5秒前
康谨发布了新的文献求助10
5秒前
5秒前
YXChen发布了新的文献求助30
6秒前
狗腿给狗腿的求助进行了留言
6秒前
淡淡紫山发布了新的文献求助10
7秒前
abin完成签到,获得积分10
7秒前
不配.应助charles采纳,获得10
7秒前
斯文败类应助cc采纳,获得10
8秒前
8秒前
8秒前
HJJ完成签到,获得积分10
8秒前
畅畅发布了新的文献求助10
8秒前
iia发布了新的文献求助10
9秒前
9秒前
Gauss完成签到,获得积分0
9秒前
嘟嘟拿铁完成签到,获得积分10
9秒前
sy发布了新的文献求助20
10秒前
11秒前
12秒前
大气的莫茗完成签到,获得积分10
13秒前
在水一方应助Photon采纳,获得10
13秒前
高分求助中
Spray / Wall-interaction Modelling by Dimensionless Data Analysis 2000
Femoral insertion of the ACL. Radiographic quadrant method 1000
ALA生合成不全マウスでの糖代謝異常の分子機構解析 520
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
2024 Medicinal Chemistry Reviews 400
Dictionary of socialism 350
Geochemistry, 2nd Edition 地球化学经典教科书第二版 300
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3194506
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2843387
关于积分的说明 8044866
捐赠科研通 2507856
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1340237
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 638902
邀请新用户注册赠送积分活动 607780