Amino acid transporter (AAT) gene family in Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn.): Characterization, expression analysis and functional prediction

苦荞 生物 基因 荞麦属 系统发育树 非生物胁迫 氨基酸 遗传学 非生物成分 植物 生物化学 古生物学 芦丁 抗氧化剂
作者
Yang Yang,Xinfang Wang,Jie Zheng,Yihan Men,Yijuan Zhang,Longlong Liu,Yuanhuai Han,Siyu Hou,Zhaoxia Sun
出处
期刊:International Journal of Biological Macromolecules [Elsevier]
卷期号:217: 330-344 被引量:5
标识
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2022.07.059
摘要

Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn., TB) is an ancient minor crop and an important food source for humans to supplement nutrients such as flavonoids and essential amino acids. Amino acid transporters (AATs) play critical roles in plant growth and development through the transport of amino acids. In this study, 104 AATs were identified in TB genome and divided into 11 subfamilies by phylogenetic relationships. Tandem and segmental duplications promoted the expansion of FtAAT gene family, and the variations of gene sequence, protein structure and expression pattern were the main reasons for the functional differentiation of FtAATs. Based on RNA-seq and qRT-PCR, the expression patterns of FtAATs in different tissues and under different abiotic stresses were analyzed, and several candidate FtAATs that might affect grain development and response to abiotic stresses were identified, such as FtAAP12 and FtCAT7. Finally, combined with the previous studies, the expression patterns and phylogenetic relationships of AATs in multiple species, the functions of multiple high-confidence FtAAT genes were predicted, and the schematic diagram of FtAATs in TB was initially drawn. Overall, this work provided a framework for further functional analysis of FtAAT genes and important clues for the improvement of TB quality and stress resistance.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
无辜的半蕾完成签到,获得积分20
刚刚
科目三应助miao采纳,获得10
刚刚
1秒前
小二郎应助呜啦啦采纳,获得200
1秒前
高兴翠绿发布了新的文献求助10
1秒前
洁净白容发布了新的文献求助10
2秒前
2秒前
优秀抽屉发布了新的文献求助10
2秒前
1222完成签到,获得积分10
2秒前
wjx关闭了wjx文献求助
3秒前
TAKI发布了新的文献求助10
3秒前
用户123完成签到,获得积分10
3秒前
栀晴完成签到,获得积分10
4秒前
zsl完成签到 ,获得积分10
4秒前
超级的语儿完成签到,获得积分10
4秒前
兴奋大船完成签到,获得积分10
5秒前
chs110完成签到,获得积分10
5秒前
Jacky完成签到,获得积分10
5秒前
树下小草完成签到,获得积分10
5秒前
冷傲的荧荧完成签到,获得积分10
6秒前
6秒前
6秒前
二月why完成签到,获得积分10
6秒前
Shad_owy完成签到 ,获得积分10
6秒前
Zhouyang完成签到,获得积分10
7秒前
时尚姒发布了新的文献求助10
7秒前
wjx关闭了wjx文献求助
7秒前
7秒前
猫丫完成签到,获得积分10
8秒前
destiny完成签到,获得积分20
8秒前
upp完成签到,获得积分20
9秒前
9秒前
木头羊发布了新的文献求助10
9秒前
oceandad完成签到,获得积分10
10秒前
栀晴发布了新的文献求助10
10秒前
拼命077发布了新的文献求助10
10秒前
ca0ca0完成签到,获得积分10
12秒前
13秒前
欣于所遇完成签到,获得积分10
13秒前
热心枕头发布了新的文献求助10
13秒前
高分求助中
Evolution 3rd edition 1500
保险藏宝图 1000
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3183955
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2834262
关于积分的说明 7998765
捐赠科研通 2496505
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1332293
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 636565
邀请新用户注册赠送积分活动 603784