Amino acid transporter (AAT) gene family in Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn.): Characterization, expression analysis and functional prediction

苦荞 生物 基因 荞麦属 系统发育树 非生物胁迫 氨基酸 遗传学 非生物成分 植物 生物化学 古生物学 芦丁 抗氧化剂
作者
Yang Yang,Xinfang Wang,Jie Zheng,Yihan Men,Yijuan Zhang,Longlong Liu,Yuanhuai Han,Siyu Hou,Zhaoxia Sun
出处
期刊:International Journal of Biological Macromolecules [Elsevier]
卷期号:217: 330-344 被引量:5
标识
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2022.07.059
摘要

Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn., TB) is an ancient minor crop and an important food source for humans to supplement nutrients such as flavonoids and essential amino acids. Amino acid transporters (AATs) play critical roles in plant growth and development through the transport of amino acids. In this study, 104 AATs were identified in TB genome and divided into 11 subfamilies by phylogenetic relationships. Tandem and segmental duplications promoted the expansion of FtAAT gene family, and the variations of gene sequence, protein structure and expression pattern were the main reasons for the functional differentiation of FtAATs. Based on RNA-seq and qRT-PCR, the expression patterns of FtAATs in different tissues and under different abiotic stresses were analyzed, and several candidate FtAATs that might affect grain development and response to abiotic stresses were identified, such as FtAAP12 and FtCAT7. Finally, combined with the previous studies, the expression patterns and phylogenetic relationships of AATs in multiple species, the functions of multiple high-confidence FtAAT genes were predicted, and the schematic diagram of FtAATs in TB was initially drawn. Overall, this work provided a framework for further functional analysis of FtAAT genes and important clues for the improvement of TB quality and stress resistance.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
John不想上班完成签到 ,获得积分10
刚刚
大雄的梦想是什么完成签到 ,获得积分10
刚刚
朱朱朱完成签到,获得积分10
1秒前
大气指甲油完成签到,获得积分10
1秒前
Autin完成签到,获得积分10
2秒前
2秒前
Richardisme完成签到,获得积分10
3秒前
4秒前
snail01完成签到,获得积分10
4秒前
文艺安青发布了新的文献求助30
4秒前
4秒前
6秒前
yu完成签到,获得积分10
7秒前
7秒前
於奎发布了新的文献求助10
7秒前
王小黑完成签到,获得积分10
7秒前
tanchihao完成签到,获得积分10
7秒前
8秒前
Hu发布了新的文献求助10
8秒前
玫瑰星云完成签到,获得积分10
8秒前
Yolo完成签到,获得积分10
9秒前
chloe完成签到,获得积分10
9秒前
AA发布了新的文献求助10
9秒前
dspan发布了新的文献求助10
9秒前
xjy1521完成签到,获得积分10
10秒前
彩色的芝麻完成签到 ,获得积分10
10秒前
跳跃完成签到,获得积分10
11秒前
朵朵发布了新的文献求助100
11秒前
W1ll发布了新的文献求助10
11秒前
璟晔完成签到,获得积分10
12秒前
爪人猫完成签到,获得积分10
12秒前
159完成签到,获得积分10
12秒前
於奎完成签到,获得积分10
13秒前
13秒前
骑驴追火箭完成签到,获得积分10
14秒前
爱笑完成签到,获得积分10
14秒前
这个郭我背了完成签到,获得积分10
14秒前
起风了完成签到 ,获得积分10
16秒前
海绵宝宝前列腺儿完成签到,获得积分10
16秒前
炙热的河马应助lm0703采纳,获得10
16秒前
高分求助中
Evolution 3rd edition 1500
保险藏宝图 1000
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3183774
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2833906
关于积分的说明 7996286
捐赠科研通 2496171
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1331952
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 636466
邀请新用户注册赠送积分活动 603660