Amino acid transporter (AAT) gene family in Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn.): Characterization, expression analysis and functional prediction

苦荞 生物 基因 荞麦属 系统发育树 非生物胁迫 氨基酸 遗传学 非生物成分 植物 生物化学 古生物学 芦丁 抗氧化剂
作者
Yang Yang,Xinfang Wang,Jie Zheng,Yihan Men,Yijuan Zhang,Longlong Liu,Yuanhuai Han,Siyu Hou,Zhaoxia Sun
出处
期刊:International Journal of Biological Macromolecules [Elsevier]
卷期号:217: 330-344 被引量:5
标识
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2022.07.059
摘要

Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn., TB) is an ancient minor crop and an important food source for humans to supplement nutrients such as flavonoids and essential amino acids. Amino acid transporters (AATs) play critical roles in plant growth and development through the transport of amino acids. In this study, 104 AATs were identified in TB genome and divided into 11 subfamilies by phylogenetic relationships. Tandem and segmental duplications promoted the expansion of FtAAT gene family, and the variations of gene sequence, protein structure and expression pattern were the main reasons for the functional differentiation of FtAATs. Based on RNA-seq and qRT-PCR, the expression patterns of FtAATs in different tissues and under different abiotic stresses were analyzed, and several candidate FtAATs that might affect grain development and response to abiotic stresses were identified, such as FtAAP12 and FtCAT7. Finally, combined with the previous studies, the expression patterns and phylogenetic relationships of AATs in multiple species, the functions of multiple high-confidence FtAAT genes were predicted, and the schematic diagram of FtAATs in TB was initially drawn. Overall, this work provided a framework for further functional analysis of FtAAT genes and important clues for the improvement of TB quality and stress resistance.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
Hello应助体贴的青烟采纳,获得10
刚刚
刚刚
青天鸟1989完成签到,获得积分10
刚刚
刚刚
奥拉同学完成签到,获得积分10
1秒前
小黄关注了科研通微信公众号
1秒前
1秒前
单薄水星完成签到,获得积分10
2秒前
2秒前
木南湖畔完成签到 ,获得积分10
3秒前
ppplll发布了新的文献求助10
4秒前
xi发布了新的文献求助10
4秒前
守墓人完成签到 ,获得积分10
4秒前
东郭秋完成签到,获得积分10
4秒前
阳光保温杯完成签到 ,获得积分10
4秒前
东东呀完成签到,获得积分10
5秒前
5秒前
科研通AI2S应助gnr2000采纳,获得10
5秒前
liuliu75完成签到,获得积分10
5秒前
HeNeArKrXeRn完成签到,获得积分10
5秒前
叶子发布了新的文献求助10
5秒前
三岁会刺猹完成签到,获得积分10
5秒前
Trailblazer完成签到,获得积分10
6秒前
glj完成签到 ,获得积分10
6秒前
7秒前
wanci应助听神吟唱采纳,获得10
7秒前
LZY发布了新的文献求助10
8秒前
8秒前
莫愁发布了新的文献求助10
9秒前
yueyue完成签到,获得积分10
9秒前
10秒前
科目三应助瘦瘦的饼干采纳,获得10
10秒前
火星上的灵竹完成签到,获得积分10
10秒前
11秒前
木南湖畔关注了科研通微信公众号
12秒前
tfr06完成签到,获得积分10
12秒前
思源应助Metakuro采纳,获得10
12秒前
王炳焜发布了新的文献求助10
13秒前
deer完成签到 ,获得积分10
13秒前
酷波er应助东郭秋采纳,获得10
14秒前
高分求助中
Evolution 3rd edition 1500
保险藏宝图 1000
Lire en communiste 1000
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
2-Acetyl-1-pyrroline: an important aroma component of cooked rice 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3181206
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2831448
关于积分的说明 7984853
捐赠科研通 2493457
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1330153
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 635934
版权声明 602955