Amino acid transporter (AAT) gene family in Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn.): Characterization, expression analysis and functional prediction

苦荞 生物 基因 荞麦属 系统发育树 非生物胁迫 氨基酸 遗传学 非生物成分 植物 生物化学 古生物学 芦丁 抗氧化剂
作者
Yang Yang,Xinfang Wang,Jie Zheng,Yihan Men,Yijuan Zhang,Longlong Liu,Yuanhuai Han,Siyu Hou,Zhaoxia Sun
出处
期刊:International Journal of Biological Macromolecules [Elsevier]
卷期号:217: 330-344 被引量:5
标识
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2022.07.059
摘要

Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn., TB) is an ancient minor crop and an important food source for humans to supplement nutrients such as flavonoids and essential amino acids. Amino acid transporters (AATs) play critical roles in plant growth and development through the transport of amino acids. In this study, 104 AATs were identified in TB genome and divided into 11 subfamilies by phylogenetic relationships. Tandem and segmental duplications promoted the expansion of FtAAT gene family, and the variations of gene sequence, protein structure and expression pattern were the main reasons for the functional differentiation of FtAATs. Based on RNA-seq and qRT-PCR, the expression patterns of FtAATs in different tissues and under different abiotic stresses were analyzed, and several candidate FtAATs that might affect grain development and response to abiotic stresses were identified, such as FtAAP12 and FtCAT7. Finally, combined with the previous studies, the expression patterns and phylogenetic relationships of AATs in multiple species, the functions of multiple high-confidence FtAAT genes were predicted, and the schematic diagram of FtAATs in TB was initially drawn. Overall, this work provided a framework for further functional analysis of FtAAT genes and important clues for the improvement of TB quality and stress resistance.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
奋斗的妙海完成签到 ,获得积分0
21秒前
23秒前
友好的牛排完成签到,获得积分10
36秒前
flj7038完成签到,获得积分0
37秒前
璐璐完成签到 ,获得积分10
37秒前
陈秋发布了新的文献求助10
38秒前
RLF完成签到,获得积分20
45秒前
chenying完成签到 ,获得积分0
46秒前
kk完成签到 ,获得积分10
52秒前
活泼的寒安完成签到 ,获得积分10
52秒前
LL完成签到,获得积分10
52秒前
DddZS完成签到 ,获得积分10
54秒前
Gang完成签到,获得积分10
55秒前
璇璇完成签到 ,获得积分10
57秒前
唯有一个心完成签到 ,获得积分10
57秒前
学术完成签到 ,获得积分10
1分钟前
初次完成签到 ,获得积分10
1分钟前
liangguangyuan完成签到 ,获得积分10
1分钟前
1分钟前
xiahongmei完成签到 ,获得积分10
1分钟前
连难胜完成签到 ,获得积分10
1分钟前
onevip完成签到,获得积分10
1分钟前
陈秋完成签到,获得积分10
1分钟前
1分钟前
WWW发布了新的文献求助10
1分钟前
1分钟前
乐观的小松鼠完成签到,获得积分10
1分钟前
婉莹完成签到 ,获得积分0
1分钟前
yangmoo发布了新的文献求助10
1分钟前
gaoxiaogao完成签到 ,获得积分10
1分钟前
齐齐完成签到,获得积分10
1分钟前
1分钟前
悠明夜月完成签到 ,获得积分10
1分钟前
香蕉不言发布了新的文献求助10
1分钟前
tesla完成签到 ,获得积分10
1分钟前
求知的周完成签到,获得积分10
1分钟前
北国雪未消完成签到 ,获得积分10
1分钟前
自有龙骧完成签到 ,获得积分10
2分钟前
HXL完成签到 ,获得积分10
2分钟前
无一完成签到 ,获得积分10
2分钟前
高分求助中
Spray / Wall-interaction Modelling by Dimensionless Data Analysis 2000
Write Like a Chemist: A Guide and Resource (第二版) 600
Mixed-anion Compounds 600
A new species of Velataspis (Hemiptera Coccoidea Diaspididae) from tea in Assam 500
Earth System Geophysics 500
Aspects of Babylonian celestial divination: the lunar eclipse tablets of Enūma Anu Enlil 500
Geochemistry, 2nd Edition 地球化学经典教科书第二版 401
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3200807
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2850569
关于积分的说明 8072421
捐赠科研通 2514308
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1347050
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 640332
邀请新用户注册赠送积分活动 610520