Amino acid transporter (AAT) gene family in Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn.): Characterization, expression analysis and functional prediction

苦荞 生物 基因 荞麦属 系统发育树 非生物胁迫 氨基酸 遗传学 非生物成分 植物 生物化学 古生物学 芦丁 抗氧化剂
作者
Yang Yang,Xinfang Wang,Jie Zheng,Yihan Men,Yijuan Zhang,Longlong Liu,Yuanhuai Han,Siyu Hou,Zhaoxia Sun
出处
期刊:International Journal of Biological Macromolecules [Elsevier]
卷期号:217: 330-344 被引量:5
标识
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2022.07.059
摘要

Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum L. Gaertn., TB) is an ancient minor crop and an important food source for humans to supplement nutrients such as flavonoids and essential amino acids. Amino acid transporters (AATs) play critical roles in plant growth and development through the transport of amino acids. In this study, 104 AATs were identified in TB genome and divided into 11 subfamilies by phylogenetic relationships. Tandem and segmental duplications promoted the expansion of FtAAT gene family, and the variations of gene sequence, protein structure and expression pattern were the main reasons for the functional differentiation of FtAATs. Based on RNA-seq and qRT-PCR, the expression patterns of FtAATs in different tissues and under different abiotic stresses were analyzed, and several candidate FtAATs that might affect grain development and response to abiotic stresses were identified, such as FtAAP12 and FtCAT7. Finally, combined with the previous studies, the expression patterns and phylogenetic relationships of AATs in multiple species, the functions of multiple high-confidence FtAAT genes were predicted, and the schematic diagram of FtAATs in TB was initially drawn. Overall, this work provided a framework for further functional analysis of FtAAT genes and important clues for the improvement of TB quality and stress resistance.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
大幅提高文件上传限制,最高150M (2024-4-1)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
大气的雪一完成签到,获得积分10
刚刚
危机的寒烟完成签到,获得积分10
1秒前
2秒前
2秒前
菅露露完成签到,获得积分20
3秒前
PQ完成签到,获得积分10
5秒前
宇宙超级无敌霹雳暴龙战士完成签到,获得积分10
5秒前
嘻嘻嘻呀完成签到,获得积分10
5秒前
Hoooo...发布了新的文献求助10
6秒前
鳗鱼焦完成签到 ,获得积分10
6秒前
Chenyao发布了新的文献求助10
7秒前
慕暖发布了新的文献求助10
7秒前
8秒前
Akim应助cwm采纳,获得10
8秒前
osel完成签到,获得积分10
8秒前
明理青寒完成签到,获得积分10
8秒前
9秒前
bkagyin应助Hoooo...采纳,获得10
9秒前
crescendo完成签到,获得积分10
10秒前
GU完成签到,获得积分10
10秒前
快乐小肥仔完成签到,获得积分10
11秒前
无所吊谓发布了新的文献求助10
14秒前
PPRer完成签到,获得积分10
14秒前
小欢关注了科研通微信公众号
14秒前
fiu~完成签到 ,获得积分10
14秒前
14秒前
zhangjianan发布了新的文献求助10
15秒前
chengzhier发布了新的文献求助10
16秒前
16秒前
osel发布了新的文献求助10
16秒前
领导范儿应助潇洒的厉采纳,获得10
16秒前
Lucky小M完成签到,获得积分10
17秒前
17秒前
科研通AI2S应助失眠的可乐采纳,获得10
18秒前
Lll完成签到 ,获得积分20
18秒前
天天快乐应助xiamu采纳,获得10
19秒前
21秒前
iNk应助Singularity采纳,获得10
21秒前
动力小滋发布了新的文献求助10
22秒前
甜甜圈发布了新的文献求助10
22秒前
高分求助中
Spray / Wall-interaction Modelling by Dimensionless Data Analysis 2000
Evolution 3rd edition 1500
Mantiden: Faszinierende Lauerjäger Faszinierende Lauerjäger 700
PraxisRatgeber: Mantiden: Faszinierende Lauerjäger 700
Mathematics and Finite Element Discretizations of Incompressible Navier—Stokes Flows 500
A new species of Coccus (Homoptera: Coccoidea) from Malawi 500
2-Acetyl-1-pyrroline: an important aroma component of cooked rice 500
热门求助领域 (近24小时)
化学 医学 生物 材料科学 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 基因 遗传学 催化作用 物理化学 免疫学 量子力学 细胞生物学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3187269
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 2837276
关于积分的说明 8013988
捐赠科研通 2499791
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1334620
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 637194
邀请新用户注册赠送积分活动 605171