Genome-wide atlas of gene expression in the adult mouse brain

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作者
Ed S. Lein,Michael Hawrylycz,Nancy Ao,Mikael Ayres,Amy Bensinger,Amy Bernard,Andrew F. Boe,Mark S. Boguski,Kevin S. Brockway,Emi J. Byrnes,Lin Chen,Li Chen,Tsuey-Ming Chen,Mei Chi Chin,Jimmy Chong,Brian E. Crook,Aneta Czaplinska,Chinh Dang,Suvro Datta,Nick Dee,Aimee L. Desaki,Tsega Desta,Ellen Diep,Tim Dolbeare,Matthew J. Donelan,Hong‐Wei Dong,Jennifer Dougherty,Ben J. Duncan,Amanda Ebbert,Gregor Eichele,Lili K. Estin,Casey Faber,Benjamin A.C. Facer,R T Fields,Shanna R. Fischer,Tim Fliss,Cliff Frensley,Sabrina N. Gates,Katie J. Glattfelder,Kevin R. Halverson,Matthew R. Hart,John G. Hohmann,Maureen P. Howell,Darren P. Jeung,Rebecca A. Johnson,Paul A. Karr,Reena Kawal,Jolene Kidney,Rachel H. Knapik,Chihchau L. Kuan,James Lake,Annabel R. Laramee,Kirk Larsen,Christopher Lau,Tracy Lemon,Agnes JH Liang,Ying Liu,Lon T. Luong,Jesse Michaels,J. S. Morgan,Rebecca J. Morgan,Marty Mortrud,Nerick F. Mosqueda,Lydia Ng,Randy Ng,Geralyn J. Orta,Caroline C. Overly,Tu H. Pak,Sheana Parry,Dev S. Pathak,Owen C. Pearson,Ralph B. Puchalski,Zackery L. Riley,Hannah R. Rockett,Stephen A. Rowland,Joshua J. Royall,Marcos J. Ruiz,Nadia R. Sarno,Katherine Schaffnit,Nadiya Shapovalova,Taz Sivisay,Cliff Slaughterbeck,Simón C. Smith,Kimberly A. Smith,Bryan I. Smith,Andy J. Sodt,Nick N. Stewart,Kenda-Ruth Stumpf,Susan M. Sunkin,Madhavi Sutram,Angelene Tam,Carey D. Teemer,Christina Thaller,Carol L. Thompson,Lee R. Varnam,Axel Visel,Ray M. Whitlock,Paul Wohnoutka,Crissa K. Wolkey,Victoria Wong,Matthew Wood,Murat Yaylaoglu,Rob Young,Brian L. Youngstrom,Xu Yuan,Bin Zhang,Theresa A. Zwingman,Allan R. Jones
出处
期刊:Nature [Springer Nature]
卷期号:445 (7124): 168-176 被引量:5237
标识
DOI:10.1038/nature05453
摘要

Molecular approaches to understanding the functional circuitry of the nervous system promise new insights into the relationship between genes, brain and behaviour. The cellular diversity of the brain necessitates a cellular resolution approach towards understanding the functional genomics of the nervous system. We describe here an anatomically comprehensive digital atlas containing the expression patterns of approximately 20,000 genes in the adult mouse brain. Data were generated using automated high-throughput procedures for in situ hybridization and data acquisition, and are publicly accessible online. Newly developed image-based informatics tools allow global genome-scale structural analysis and cross-correlation, as well as identification of regionally enriched genes. Unbiased fine-resolution analysis has identified highly specific cellular markers as well as extensive evidence of cellular heterogeneity not evident in classical neuroanatomical atlases. This highly standardized atlas provides an open, primary data resource for a wide variety of further studies concerning brain organization and function.
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