Selection of single-stranded DNA molecules that bind and inhibit human thrombin

适体 凝血酶 DNA 指数富集配体系统进化 SELEX适体技术 化学 核酸 生物化学 寡核苷酸 碱基对 分子生物学 生物 核糖核酸 基因 血小板 免疫学
作者
Louis C. Bock,Linda C. Griffin,John Latham,Eric H. Vermaas,John J. Toole
出处
期刊:Nature [Springer Nature]
卷期号:355 (6360): 564-566 被引量:2358
标识
DOI:10.1038/355564a0
摘要

Aptamers are double-stranded DNA or single-stranded RNA molecules that bind specific molecular targets. Large randomly generated populations can be enriched in aptamers by in vitro selection and polymerase chain reaction. But so far single-stranded DNA has not been investigated for aptamer properties, nor has a target protein been considered that does not interact physiologically with nucleic acid. Here we describe the isolation of single-stranded DNA aptamers to the protease thrombin of the blood coagulation cascade and report binding affinities in the range 25-200 nM. Sequence data from 32 thrombin aptamers, selected from a pool of DNA containing 60 nucleotides of random sequence, displayed a highly conserved 14-17-base region. Several of these aptamers at nanomolar concentrations inhibited thrombin-catalysed fibrin-clot formation in vitro using either purified fibrinogen or human plasma.
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