2A and 2A-like Sequences: Distribution in Different Virus Species and Applications in Biotechnology

生物 核糖核酸 计算生物学 多聚蛋白质类 异源的 病毒 翻译(生物学) RNA病毒 序列(生物学) 遗传学 信使核糖核酸 基因
作者
Juliana G.S. de Lima,Daniel Carlos Ferreira Lanza
出处
期刊:Viruses [MDPI AG]
卷期号:13 (11): 2160-2160 被引量:1
标识
DOI:10.3390/v13112160
摘要

2A is an oligopeptide sequence that mediates a ribosome "skipping" effect and can mediate a co-translation cleavage of polyproteins. These sequences are widely distributed from insect to mammalian viruses and could act by accelerating adaptive capacity. These sequences have been used in many heterologous co-expression systems because they are versatile tools for cleaving proteins of biotechnological interest. In this work, we review and update the occurrence of 2A/2A-like sequences in different groups of viruses by screening the sequences available in the National Center for Biotechnology Information database. Interestingly, we reported the occurrence of 2A-like for the first time in 69 sequences. Among these, 62 corresponded to positive single-stranded RNA species, six to double stranded RNA viruses, and one to a negative-sense single-stranded RNA virus. The importance of these sequences for viral evolution and their potential in biotechnological applications are also discussed.
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