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A Streamlined PENK Methylation Test in Urine DNA, EarlyTect BCD, Effectively Detects Bladder Cancer in Hematuria Patients

尿 膀胱癌 DNA甲基化 甲基化 医学 DNA 癌症 泌尿科 生物 肿瘤科 癌症研究 内科学 基因 遗传学 基因表达
作者
Bo‐Ram Bang,Jin Zhong,Tae Jeong Oh,Ji‐Yong Lee,Young-Jin Seo,Min A Woo,Jae Sung Lim,Yong Gil Na,Ki Hak Song,Ju Hyun Shin,Justin Junguek Lee,Chan Im,Seoyong Kim,Safedin Beqaj,Joseph Shirk,Katelyn W. Ke,John Vallone,Sungwhan An
出处
期刊:The Journal of Molecular Diagnostics [Elsevier]
标识
DOI:10.1016/j.jmoldx.2024.04.001
摘要

Abstract

The current noninvasive diagnostic approaches for detecting bladder cancer (BC) often exhibit limited clinical performance, especially for the initial diagnosis. This study aims to evaluate the validity of a streamlined urine-based PENK methylation test called EarlyTect BCD in detecting BC in hematuria patients scheduled for cystoscopy in Korean and American populations. The test seamlessly integrates two steps, linear target enrichment, and quantitative methylation-specific PCR within a single closed tube. The detection limitation of the test was approximately two genome copies of methylated PENK per milliliter of urine. In the retrospective training set (n = 105), an optimal cutoff value was determined to distinguish BC from non-BC, resulting in a sensitivity of 87.3% and a specificity of 95.2%. In the prospective validation set (n = 210, 122 Korean and 88 American), the overall sensitivity for detecting all stages of BC was 81.0%, with a specificity of 91.5% and an area under the curve value of 0.889. There was no significant difference between the two groups. The test achieved a sensitivity of 100% in detecting high-grade Ta and higher stages of BC. The negative predictive value of the test was 97.7%, and the positive predictive value was 51.5%. The findings of this study demonstrate that EarlyTect BCD is a highly effective noninvasive diagnostic tool for identifying BC among hematuria patients.
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