Mendelian Randomization Study Using Dopaminergic Neuron‐Specific eQTL Nominates Potential Causal Genes for Parkinson's Disease

孟德尔随机化 多巴胺能 表达数量性状基因座 帕金森病 LRRK2 遗传学 生物 全基因组关联研究 疾病 遗传关联 孟德尔遗传 基因 神经科学 医学 单核苷酸多态性 多巴胺 内科学 突变 基因型 遗传变异
作者
Xinglun Dang,Zhijun Zhang,Xiong‐Jian Luo
出处
期刊:Movement Disorders [Wiley]
卷期号:37 (12): 2451-2456 被引量:9
标识
DOI:10.1002/mds.29239
摘要

Abstract Background Large‐scale genome‐wide association studies (GWASs) have reported multiple risk variants for Parkinson's disease (PD). However, little is known about how these reported risk variants confer risk of PD. Objective To nominate genes whose genetically regulated expression in dopaminergic neurons may have a causal role in PD. Methods We conducted a two‐sample Mendelian randomization (MR) study by integrating large‐scale genome‐wide associations and expression quantitative trait loci (eQTL) data from dopaminergic neurons. Results MR analysis nominated 10 risk genes whose genetically regulated expression in dopaminergic neurons may have a causal role in PD. These MR significant genes include FAM200B, NDUFAF2, NUP42, SH3GL2, STX1B, CCDC189, KAT8 , PRSS36, VAMP4, and ZSWIM7 . Conclusions We report the first MR study of PD by using dopaminergic neuron‐specific eQTL and nominate novel risk genes for PD. Further functional characterization of the nominated risk genes will provide mechanistic insights into PD pathogenesis and potential therapeutic targets. © 2022 International Parkinson and Movement Disorder Society.
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