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Validation of a New Methodology to Create Oral Drugs beyond the Rule of 5 for Intracellular Tough Targets

细胞内 化学 环肽 小分子 计算生物学 组合化学 药物发现 纳米技术 生物化学 材料科学 生物
作者
Atsushi Ohta,Mikimasa Tanada,Shojiro Shinohara,Yuya Morita,Kazuhiko Nakano,Y. Yamagishi,Ryusuke Takano,Shiori Kariyuki,Takeo Iida,Atsushi Matsuo,Kazuhisa Ozeki,Takashi EMURA,Yuuji Sakurai,Koji Takano,Atsuko Higashida,Miki Kojima,Terushige Muraoka,Ryuuichi Takeyama,Tatsuya Kato,Kaori Kimura,Kotaro Ogawa,Kazuhiro Ohara,Shota Tanaka,Yasufumi Kikuchi,Nozomi Hisada,Ryuji Hayashi,Yoshikazu Nishimura,Kenichi Nomura,Tatsuhiko Tachibana,Machiko Irie,Hatsuo Kawada,Takuya Torizawa,Naoaki Murao,Tomoya Kotake,Masahiko Tanaka,Shiho Ishikawa,Taiji Miyake,Minoru Tamiya,M. ARAI,Aya Chiyoda,Akai Sho,Hitoshi Sase,Shino Kuramoto,Toshiya Ito,Takuya Shiraishi,Tetsuo Kojima,Hitoshi Iikura
出处
期刊:Journal of the American Chemical Society [American Chemical Society]
卷期号:145 (44): 24035-24051 被引量:25
标识
DOI:10.1021/jacs.3c07145
摘要

Establishing a technological platform for creating clinical compounds inhibiting intracellular protein-protein interactions (PPIs) can open the door to many valuable drugs. Although small molecules and antibodies are mainstream modalities, they are not suitable for a target protein that lacks a deep cavity for a small molecule to bind or a protein found in intracellular space out of an antibody's reach. One possible approach to access these targets is to utilize so-called middle-size cyclic peptides (defined here as those with a molecular weight of 1000-2000 g/mol). In this study, we validated a new methodology to create oral drugs beyond the rule of 5 for intracellular tough targets by elucidating structural features and physicochemical properties for drug-like cyclic peptides and developing library technologies to afford highly N-alkylated cyclic peptide hits. We discovered a KRAS inhibitory clinical compound (LUNA18) as the first example of our platform technology.
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