Dissecting metal ion–dependent folding and catalysis of a single DNAzyme

脱氧核酶 核酶 费斯特共振能量转移 化学 劈理(地质) 生物物理学 蛋白质折叠 折叠(DSP实现) 组合化学 构象变化 结晶学 金属 荧光 生物化学 DNA 核糖核酸 材料科学 生物 有机化学 基因 电气工程 物理 工程类 复合材料 量子力学 断裂(地质)
作者
Hee-Kyung Kim,Ivan Rasnik,Juewen Liu,Taekjip Ha,Yi Lu
出处
期刊:Nature Chemical Biology [Nature Portfolio]
卷期号:3 (12): 763-768 被引量:148
标识
DOI:10.1038/nchembio.2007.45
摘要

Protein metalloenzymes use various modes for functions for which metal-dependent global conformational change is required in some cases but not in others. In contrast, most ribozymes require a global folding that almost always precedes enzyme reactions. Herein we studied metal-dependent folding and cleavage activity of the 8–17 DNAzyme using single-molecule fluorescence resonance energy transfer. Addition of Zn2+ and Mg2+ induced folding of the DNAzyme into a more compact structure followed by a cleavage reaction, which suggests that the DNAzyme may require metal-dependent global folding for activation. In the presence of Pb2+, however, the cleavage reaction occurred without a precedent folding step, which suggests that the DNAzyme may be prearranged to accept Pb2+ for the activity. Neither ligation reaction of the cleaved substrates nor dynamic changes between folded and unfolded states was observed. These features may contribute to the unusually fast Pb2+-dependent reaction of the DNAzyme. These results suggest that DNAzymes can use all modes of activation that metalloproteins use.
最长约 10秒,即可获得该文献文件

科研通智能强力驱动
Strongly Powered by AbleSci AI
更新
PDF的下载单位、IP信息已删除 (2025-6-4)

科研通是完全免费的文献互助平台,具备全网最快的应助速度,最高的求助完成率。 对每一个文献求助,科研通都将尽心尽力,给求助人一个满意的交代。
实时播报
逢考必过完成签到 ,获得积分10
1秒前
2秒前
霸王啵啵虎完成签到,获得积分20
2秒前
3秒前
魏少爷发布了新的文献求助10
3秒前
小马甲应助de采纳,获得10
3秒前
4秒前
4秒前
Hello应助zlf采纳,获得10
5秒前
思源应助zgh采纳,获得10
6秒前
6秒前
宋宋发布了新的文献求助10
8秒前
学习通发布了新的文献求助10
11秒前
完美世界应助吴祥坤采纳,获得10
11秒前
ikun发布了新的文献求助10
11秒前
无花果应助冬至季采纳,获得10
12秒前
whale完成签到,获得积分10
13秒前
15秒前
kuyi完成签到 ,获得积分10
16秒前
16秒前
17秒前
一心向雨完成签到,获得积分10
18秒前
丘比特应助澜澜采纳,获得10
21秒前
21秒前
ljx发布了新的文献求助10
22秒前
负责的寒梅完成签到,获得积分10
24秒前
pluto应助天气好好采纳,获得10
25秒前
英姑应助明理采珊采纳,获得10
27秒前
忧伤的真菌完成签到,获得积分10
28秒前
量子星尘发布了新的文献求助10
30秒前
30秒前
30秒前
bkagyin应助魏少爷采纳,获得10
31秒前
无花果应助澡雪采纳,获得10
33秒前
34秒前
34秒前
36秒前
Hello应助Gtingting采纳,获得10
36秒前
深情安青应助宋宋采纳,获得10
36秒前
小药丸完成签到,获得积分10
36秒前
高分求助中
A new approach to the extrapolation of accelerated life test data 1000
Picture Books with Same-sex Parented Families: Unintentional Censorship 700
ACSM’s Guidelines for Exercise Testing and Prescription, 12th edition 500
Nucleophilic substitution in azasydnone-modified dinitroanisoles 500
不知道标题是什么 500
Indomethacinのヒトにおける経皮吸収 400
Phylogenetic study of the order Polydesmida (Myriapoda: Diplopoda) 370
热门求助领域 (近24小时)
化学 材料科学 医学 生物 工程类 有机化学 生物化学 物理 内科学 纳米技术 计算机科学 化学工程 复合材料 遗传学 基因 物理化学 催化作用 冶金 细胞生物学 免疫学
热门帖子
关注 科研通微信公众号,转发送积分 3975814
求助须知:如何正确求助?哪些是违规求助? 3520123
关于积分的说明 11201020
捐赠科研通 3256502
什么是DOI,文献DOI怎么找? 1798347
邀请新用户注册赠送积分活动 877523
科研通“疑难数据库(出版商)”最低求助积分说明 806417